Gastroenteritisli köpeklerde viral etkenlerin PCR ile araştırılması

Karaoğlu M. T., Özkan S.

Antakya Veteriner Bilimleri Dergisi - The Journal of Antakya Veterinary Sciences, cilt.4, sa.2, ss.18-24, 2025 (Hakemli Dergi)

Özet

Gastroenteritis, köpeklerde sıklıkla karşılaşılan önemli bir klinik tablodur. Hastalık; viral, bakteriyel, paraziter veya toksik birçok etkene bağlı olarak gelişebilmekte olup, özellikle genç hayvanlarda hızlı seyirli olabilmekte ve hatta ölümcül seyredebilmektedir. Özellikle son yıllarda viral ajanların da hastalığın ortaya çıkışında ve yayılışında önemli bir rol oynadığı görülmektedir.

Bu çalışmada, gastroenteritisli köpeklerde viral etkenlerin varlığının araştırılması, enterik viral patojenlerin belirlenmesi, koenfeksiyon durumlarının ortaya koyulması ve tespit edilen virusların genetik karakterizasyonlarının yapılması amaçlanmıştır. Araştırma kapsamında, Ankara’daki veteriner kliniklerine gastroenteritis semptomlarıyla getirilen sahipli 61 köpekten dışkı/rektal sürüntü örnekleri toplanmıştır. Örnekler; Canine parvovirus (CPV), Canine circovirus (CaCV), Canine rotavirus (CRV), Canine coronavirus (CCoV), Caliciviridae ailesine ait viruslar (norovirus, sapovirus, vesivirus), Canine astrovirus (CaAstV) ve Canine distemper virus (CDV) açısından konvansiyonel PCR yöntemine tabi tutulmuşlardır. Toplam 61 örneğin 17’si CPV (%27,9), 3’ü CaCV (%4,9), 2’si CRV (%3,3), 35’i CCoV (%57,4), 1’i Caliciviridae (%1,6), 5’i CaAstV (%8,2) ve 7’si CDV (%11,5) yönünden pozitif bulunmuştur. Bazı köpeklerde iki veya daha fazla etkenin birlikte bulunduğu koenfeksiyonlar saptanmıştır.

CPV-2 VP2 gen bölgesine dayalı filogenetik analizde, bu çalışmadan elde edilen CPV-2 izolatlarının referans dizileriyle birlikte CPV-2b kümesi içinde yer aldığı belirlenmiştir. CDV L gen bölgesinin filogenetik analizi, CDV izolatlarının, Asia-1 referans dizileriyle aynı ana dallarda kümelenme eğilimi gösterdiğini ortaya koymuştur. CCoV M gen bölgesinin filogenetik analizinde CCoV izolatlarının CCoV-IIa, CCoV-IIb ve CCoV-I referansları ile yakın filogenetik ilişkiler sergilediğini ortaya koymuştur. CAstV ORF1b (RdRp) gen bölgesi filogenetik analizinde ise CAstV örneklerimiz Mamastrovirus-5 lineaj-1 referans dizileri içerisinde gruplandırıldırılmıştır.