Autophagy in viral infections Viral enfeksiyonlarda otofaji


Creative Commons License

Ülgenalp O., Koç B. T., OĞUZOĞLU T. Ç.

Turk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, cilt.75, sa.3, ss.291-304, 2018 (Scopus) identifier

  • Yayın Türü: Makale / Derleme
  • Cilt numarası: 75 Sayı: 3
  • Basım Tarihi: 2018
  • Doi Numarası: 10.5505/turkhijyen.2018.79923
  • Dergi Adı: Turk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi
  • Derginin Tarandığı İndeksler: Scopus, TR DİZİN (ULAKBİM)
  • Sayfa Sayıları: ss.291-304
  • Anahtar Kelimeler: Autophagy, Cell death, Hücre ölümü, Otofaji, Viral enfeksiyon, Viral infection
  • Ankara Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

© 2018 Refik Saydam National Public Health Agency (RSNPHA).Viruslar hücre içi obligat parazit olmalarindan ve birçok virus ailesinin farkli replikasyon stratejileri olmasindan ötürü diğer mikroorganizmalara kiyasla hücre içi daha çok organel ve işlev ile yakin ilişkili olup bu mekanizmalar üzerinde etkileri mevcuttur. Bu etkilerin başinda da hiç şüphesiz hücre ölüm mekanizmalari yer almaktadir. Viruslar ile yapilan replikasyon-patogenez çalişmalarinda hücre ölümü olarak apoptoz ve nekroz üzerine pekçok çalişma yapilmiştir. Otofaji ise son yillara kadar viral enfeksiyonlarda çok değerlendirilmemiş ama gündeme gelmesiyle viral enfeksiyonlarla ilişkisi araştirilmaya başlanmiştir. Otofaji ("Auto" ve "Phagy"; kelime anlami "kendi kendini yeme"); hücrelerin çeşitli stres durumlarinda kendilerini yok olmaktan korumak ve hemostazi devam ettirmek için kullandiklari katabolik bir süreç olup hücre bu süreçte ihtiyaci olan enerjiyi kendi öz kaynaklarini sindirerek elde eder. Otofaji; organizmada çift katli membrana sahip vezikül oluşumu ile şekillenen ve makro-, mikro-, şaperon ilişkili- otofaji olmak üzere bugüne dek tanimlanmiş üç çeşidi bulunan fizyolojik bir olaydir. Son yillarda otofaji ve viral enfeksiyonlarla ilgili çalişmalarin sayisinda hizli bir artis yasanmasinin sonucu olarak; otofaji ve viruslar arasindaki karşilikli etkileşim, DNA veya RNA virusu ailesinde bulunan birçok virus türü için araştirma konusu olarak ilgi çekmiştir. Viruslarin otofaji mekanizmasini immünolojik yanittan kaçabilmek ve viral yaşam döngülerini devam ettirebilmek adina nasil kullandiklari ve viral patogenezin moleküler mekanizmalarinda otofajinin yerinin sorgulanmasi temel çalişma konularini oluşturmaktadir. Bu araştirmalar işiğinda elde edilen bilgilere göre; otofaji ve viruslar arasinda iki tarafi keskin bir biçağa benzetilebilecek bir ilişki bulunmaktadir. Hücre ölüm mekanizmalarindan olan apoptoz ve nekrozdan farkli olarak bu fizyolojik olay; hücrenin stres durumunda oluşan besin ihtiyacina bir cevap olarak ortaya çikacaği gibi, konakçi hücrenin bazi patojenlerden kurtulmak amaciyla başlattiği bir seri mekanizmayi da tetiklemektedir. Hatta bu olay, viruslar tarafindan kendi lehlerine olacak şekilde replikasyonlarini başlatabilmek veya devam ettirebilmek ve viral zarflarinin oluşumuna yardimci olarak da kullanilmaktadir. Bu fizyolojik olay ile viruslar arasindaki ilişkiyi anlamaya yönelik bilgilerin sunulduğu bu derlemede; otofaji mekanizmalari, kullanilan yolaklar, otofajiyi uyaran ve başlatan proteinler, otofajinin çeşitli viruslar (tek başina bir virus veya ayni aileden iki virus arasindaki etkileşim durumunda) tarafindan nasil kullanildiğina yönelik bilgiler bulunmaktadir. © 2018 Refik Saydam National Public Health Agency (RSNPHA).Because of the fact that viruses are intracellular obligatory parasites and many virus families have different replication strategies, their intracellular interactions are more closely related to organelles and function than other microorganisms and they have effects on these functions. Undoubtedly, cell death mechanisms are located at the top of these effects. Many studies have been carried out on apoptosis and necrosis as cell death in replication-pathogenesis studies performed with viruses. Autophagy has not been evaluated in viral infections until recent years, however, by the fact that autophagy has become a popular topic in biotechnology, investigation of the relationship between autophagy and viral infections has been begun.Autophagy ("Auto" and "Phagy", meaning "self-eating"); is a catabolic process that cells use to protect themselves from extinction in various stress situations and to maintain hemostasis, and the cell obtains the energy it needs by digesting its own resources. Autophagy; the organism is a physiological phenomenon with two types of membrane-shaped vesicle formation and three types of macro-, micro-, and chaperone-related autophagy up-to-date. As a result of a rapid increase in the number of studies on autophagy and viral infections in recent years, the interaction between autophagy and viruses has attracted interest as a research topic for many types of viruses in the family of DNA or RNA viruses. The fact of how viruses use the autophagy mechanism to avoid immunological response and maintain viral life cycles and to question the location of autophagy in the molecular mechanisms of viral pathogenesis constitute main study subjects. According to the obtained information in the context of these studies; there is a relationship between autophagy and viruses that can be likened to a sharp blade on both sides. Unlike apoptosis and necrosis, this physiological event; it also triggers a series of mechanisms initiated by the host cell to get rid of some pathogens, as will the response of the cell to the need for nutrients in the event of stress. In fact, this incident will be in their favor by the viruses; replication can be initiated or sustained and used to assist in the formation of viral envelopes. In this review in which present information on relation between viruses and this physiological pathway; there are the knowledge that autophagy mechanism, pathways, proteins stimulating and starting autophagy, how to use autophagy by various viruses.