Oküler yüzey epitelinde bulunan prekursör hücrelerde ifade bulan genler
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, TIBBİ GENETİK ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2009
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: M. A. MURAT AKINCI
Danışman: HATİCE ILGIN RUHİ
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Oküler Yüzey Epitelinde Bulunan Prekursör Hücrelerde İfade Bulan GenlerLimbus ve konjunktiva epitelinden izole edilmiş kenar popülasyon (side population (SP)) hücreleri, doku kök hücresi olarak bilinen, in vivo olarak yavaş bölünen hücrelerden türemektedirler. Bu çalışmanın amacı; global diferansiyel gen ifadesini ve markerleri tanımlamak ve bu hücrelerin fenotipleri ile ilişkili sinyal yolakları ile konjunktival SP hücrelerinin moleküler imzasını ortaya koymaktadır.?Hoechst? 33342 ile boyanan gece boyunca kültüre edilmiş taze olarak izole edilmiş insan konjunktival epitelyal hücreleri SP ve n-SP grupları olarak ?flow? sitometri aracılığı ile ayrıştırılmıştır. İzole edilmiş RNA oligonükleotid yerleştirilmiş dizin (array) kullanılarak mikro-array analizi için yürütülmüştür. Sonuçların kantitatif PCR ve immünolojik yöntemler ile gen ve protein seviyelerinde geçerlilikleri denetlenmiştir. Veri ayrıştırma yöntemleri kök hücre fonksiyonu ile ilgili hücresel işlemleri tanımlamak için kullanılmıştır.Mevcut/namevcut programa dayalı transkriptlerin ifadesinin karşılaştırmalı analizi dizinde temsil edilen 24 000 özgün genden 10 266 sını içeren 16 993 tanımlanmış konjunktival epitelyal transkriptlerin 4'lü olarak tekrarlanmış çalışmalarında kullanılmıştır. Bu genlerin 1 254 ve 393 tanesi SP içinde sırasıyla; fazla ifade (>2-kat) veya (<0,5-kat) daha az ifade bulmaktadır. Fazla ifade bulan grup; a) kök hücresinin kendini yenilemesi b) hücrenin sağ kalımı c) bölünme oranları ve ifadeleri epitel için tipik olmayan genler ile ilişkili (ör., CD62E) proteinleri kodlayan genleri içermektedir.Konjunktival SP hücrelerinin moleküler imzası kök hücre fenotipi ile uyumludur. Gen ifade modelleri doku kök hücreleri ile ilişkili nitelikler olan yavaş bölünmeyi ve plastisiteyi destekler. Sonuçlar epitelyal kök hücrelerinin korunması ve/veya genişlemesi hakkında değerli anlayışlar sağlar.Anahtar söcükler: CD62E, dual spesifik fosfatazlar, Konjunktival epitelyum, kök hücreleri, SP hücreleri