HÜCRE DUVARI PROTEİN PROFİLLERİ VE PİLAZMİD İÇERİKLERİNE GÖRE LAKTİK ASİT BAKTERİLERİNİN MOLEKÜLER TANISI


Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2006

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Fadime KIRAN

Danışman: ÖZLEM OSMANAĞAOĞLU

Özet:

Hazır gıdalardan izole edilen ve çeşitli kültür koleksiyonlarından temin edilen 88 adet farklı Laktik Asit Bakterisinin (LAB) jel elektroforezi ile pilazmid DNA’larının analizi ve Sodyum dodesil sülfat poliakrilamid jel elektroforezi ile (SDS-PAGE) hücre duvarı protein profillerinin analizi; gerçekleştirmiş olduğumuz fizyolojik, biyokimyasal/metabolik ve morfolojik testler üzerine kurulmuş olan geleneksel fenotipik tanımlama yöntemlerini desteklemek ve bu bakterileri tanımlamak amacı ile yapılmıştır. Farklı türlerin hatta aynı tür içindeki suşların değişen ve tipik olan protein bant patternleri sunmasından dolayı, hücre duvarı proteinleri ile tanımlama tür, bazen de suşa spesifik patternlerin tespiti ile mümkündür. Bu yöntem standartı gerçekleştirilmiş koşullarda; tür ve alttür seviyesinde taksonomik ayrımda iyi sonuçlar vermesinden dolayı tüm suşların tiplendirilmesinde ve protein patternlerinin oluşturulmasında dikkate alınabilir. Bu bağlamda hücre duvarı proteinlerinin SDS-PAGE’i birçok tür içeren fazla sayıda Laktik Asit Bakteri izolatlarının tanımlanmasında kolay, oldukça hızlı ve güvenilir bulunmaktadır. Benzerliklerine bakıldığında pilazmid DNA’nın jel elektroforez bant patternleri; cins ve bazı durumlarda tür bazında ayrım için kullanılmıştır. Laktik Asit Bakterilerinde pilazmid DNA profilleri değişkendir ve her cins için karakteristlik bantlar gözlenmiştir.