Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2023
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: MERVE DİLEK KARATAŞ
Danışman: Ali Ergül
Özet:
Fusarium oxysporum melongenae patlıcanda verimliliği etkileyen biyotik faktörlerden
birisidir. Bu tez çalışması kültür türünde bulunmayan bu patojen dayanıklılığını; türler
arası melezlemelerle sonraki generasyonlara geçirebilmek, bu generasyonlarda meydana
gelen transkripsiyonel düzenlemeler hakkında bilgi edinebilmek amacı ile yapılmıştır.
Solanum melongena ve Solanum macrocarpon türleri melezlenmiş; sonrasında
kendilemeler yapılarak F2 generasyonu elde edilmiştir. Ana – baba - F1 - F2
generasyonlarında patolojik testlemeler yapıldıktan sonra RNA sekanslama ile
transkriptom analizi gerçekleştirilmiştir. Elde edilen transkriptler ile generasyonlar boyu,
hassas-dayanıklı örnekler arasında karşılaştırmalar yapılmış ortak genler belirlenmiştir.
Toplamda 70195 unigen tespit edilmiştir. Gen ontoloji analizi ile katalitik aktivite, hücresel
süreç, metabolik süreç gibi biyolojik işlemlerin Fusarium oxysporum melongenae
patojenine dayanıklılıkta, örnekler arasında farklı şekillerde düzenlendiği belirlenmiştir.
Sonuç olarak bu çalışma ile türler arası melezleme ve sonraki generasyonda bitki
yapraklarından karşılaştırılabilir bir transkriptom yanıtı elde edilmiştir. Bu RNA dizileme
analizi ile elde edilen verilerin patlıcandaki ıslah çalışmalarına önemli ölçüde katkı
sağlayacağı düşünülmektedir.