Tavuklardan izole edilen Avibacterium paragallinarum suşlarının moleküler tanısı ve tiplendirilmesi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, VETERİNERLİK MİKROBİYOLOJİSİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2009
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: SİBEL GÜNGÖRDÜ
Danışman: MEHMET AKAN
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Tavuklardan İzole Edilen Avibacterium paragallinarum Suşlarının Moleküler Teşhisi ve Tiplendirilmesi.Bu çalışmada solunum sistemi problemi olan yumurtacı, broyler ve broyler damızlık sürülerde A. paragallinarum'un izolasyonu, identifikasyonu, moleküler teşhis ve tiplendirilmesi amaçlandı. Bu amaçla toplam 95 kümesten toplam 500 adet tavuğun infraorbital sinuslarından alınan svap örnekleri kültür ve PCR ile incelendi. Alınan svap örnekleri izolasyon amacıyla özel besiyerlerine ekildi ve uygun koşullarda inkube edildi. İnkubasyon sonrasında şüpheli koloniler makroskopik ve mikroskopik morfolojileri ile biyokimyasal özellikleri incelenerek identifiye edildi. İzole edilen saha suşlarının ve Kume referans suşlarının PCR ile doğrulanmasından sonra moleküler tiplendirmeleri ERIC-PCR ile gerçekleştirildi.İncelenen 95 kümesin 3 (% 3,15)'ünden A. paragallinarum izole edildi. İzolasyon sadece yumurtacı kümeslerden gerçekleştirilirken, broiler damızlık ve broiler sürülere ait materyallerden izolasyon ve PCR ile etken tespiti yapılamadı. Direct-PCR ile yapılan çalışmalarda 11 yumurtacı sürü/30 hayvanda A. paragallinarum pozitifliği belirlendi. ERIC-PCR ile tiplendirilen Kume referans suşları ve A. paragallinarum izolatlarının ERIC paternleri arasında farklılıklar saptandı. Aynı kümesten izole edilen A. paragallinarum izolatlarının ERIC paternlerinin aynı olduğu tespit edildi.Sonuç olarak, İnfeksiyöz Koriza şüpheli tavuklarda PCR ile izolasyona göre daha yüksek oranda pozitiflik saptanması, A. paragallinarum infeksiyonlarının rutin teşhisinde PCR tekniğinin kullanılabilirliğini ve yararlılığını ortaya koydu. Ayrıca izolasyon yapılan ve PCR ile pozitif bulunan materyallerin yumurtacı sürülere ait olması, A. paragallinarum infeksiyonunun yumurtacılar için daha önemli bir infeksiyon olduğunu gösterdi. Elde edilen bulgular, A. paragallinarum infeksiyonuna bağlı kayıpların ortadan kaldırılmasında aşılamalarında yer aldığı koruma ve kontrol önlemlerinin eksiksiz yürütülmesi gerektiğini ortaya koydu.Anahtar sözcükler: A. paragallinarum, izolasyon, PCR, tavuk