Tavuk dışkıları ve çevresel örneklerden salmonella infantis fajlarının izolasyonu ve karakterizasyonu
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2018
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: EBRU TORUN
Danışman: HAMİT KAAN MÜŞTAK
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu tez çalışmasında, Türkiye'de en çok izole edilen kanatlı Salmonella serotipi olan S. Infantis'in bakteriyofajlarının izolasyonu ve bu fajların konak spektrumunun belirlenmesi ayrıca bu fajların su yem ve altlık materyallerindeki etki, yaşam süreleri ve saklama sürelerinin saptanması hedeflendi. Çalışmada, Ankara ve Bolu illerinde yer alan kanatlı işletmelerinden ve kanatlı mezbahalarından toplanan 50 adet dışkı-altlık ve 50 adet atık su örneğinden agar overlay metodu ile 38 adet S. Infantis fajı izole edildi. Bu fajların, Rutin Test Dilüsyonları ve 200 adet S. Infantis suşunda litik spektrumları ve litik profilleri agar-overlay ve spot test metodları kullanılarak belirlenendi ve ayrıca genotipik karakterizasyon amacıyla RAPD-PCR metodu uygulandı. Çalışmalar sonucunda tüm veriler analiz edildi. Bu analiz sonucunda, litik profilleri ve RAPD homoloji düzeyleri birbirinden farklı olup en yüksek litik spektruma sahip (SF-In7, %94,5; SF-In20, %94) olan fajlarının faj-bakteri dinamikleri çalışmaları yapıldı. Bu fajların adsorbsiyon oranı 20 dk da %95 ve latent dönelerim sırasıyla 57 dk ve 65 dk olarak belirlendi. Deneysel çalışmalarda SF-In7 ve SF-In20 fajlarının 24 saatte canlı S. Infantis sayısını su materyalinde 4 log10 cfu/ml (p<0,001), altlık ve yem materyalinde 2-3 log10 cfu/ml (p<0,001), azalttığı, konak hücre bulundurmayan su materyalinde 4 hafta, altlık ve yem materyallerinde ise 3 hafta yaşadığı tespit edildi. Ayrıca çalışmada, SF-In7 ve SF-In20 fajlarının oda ısında (20-22°C) 6 hafta, +4 °C'de 9 ay, -20°C ve -80°C'de ise 4 yıldan fazla canlılıklarını korudukları belirlendi. Çalışma sonucunda, SF-In7 ve SF-In20 fajlarının S. Infantis kontaminasyonunu azaltmada biyokontrol ajanı olarak kullanılabileceği, geniş saklama ısısı ve uzun yaşam süresi sebebiyle saha, kümes, kesimhane gibi ortamlarda uygulanmadan önce uzun süre kolaylıkla saklanabileceği, bununla beraber özellikle ticari olarak faj üretimi esnasında da uzun yıllar faj preparatlarının kaybedilmeden korunabileceği sonucu çıkarılmıştır.