Salmonella typhimurium seqA mutantlarında biyofilm regülasyonununtranskriptomik analizi

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, BİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2021

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: ELİF GAMZE HAS

Danışman: MUSTAFA AKÇELİK

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu tez çalışmasının ilk aşamasında, S. Typhimurim 14028 doğal suşu ve onun seqA geni bakımından delesyonlu mutantının biyofilm oluşturma özelliklerinin farklı antimikrobiyal ajanlara ve metabolitlere karşı verdiği yanıtlar incelendi. Bu denemelerden elde edilen verilerden; artan glukoz (% 1-% 3) ve safra tuzu (% 0,1-0,9) konsantrasyonlarında doğal suş ve mutantta biyofilm oluşumunun yüksek oranda engellendiği saptandı. Ayrıca antimikrobiyal ajanların tanımlanan farklı antibiyofilm etkinliklerinin, 1 mg/mL nisin + 10 mM EDTA + 5 µg/mL CIP (siprofloksasin) kombinasyonu kullanılarak en yüksek düzeye ulaştığı belirlendi. Çalışmanın ikinci aşamasında, S. Typhimurium dağal suşu ve seqA mutantında karşılaştırmalı transkriptomik (mRNA ve miRNA) analizler yürütülerek; seqA geninin biyofilm oluşumunun yanında, genel metabolizma üzerindeki regülasyon karakteristikleri incelendi. Bu çalışmalar söz konusu genlerin biyofilm oluşumu ile ilişkili genler yanında, merkezi metabolizmada rol oynayan proteinleri kodlayan birçok genin regülasyonunda rol oynadığını kanıtladı. Bu global regülatör özellikleri, bilimsel açıdan yeni verilerdir ve Salmonella ile mücadelede söz konusu SeqA proteininin inhibitörleri kullanılabileceğine işaret etmesi açısında da kritik bir önem taşımaktadır.