Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida albicans ve candida dublinienses suşlarının genotiplendirilmesi ve moleküler yöntemlerin tanıdaki yerinin araştırılması
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Tıp Fakültesi, MİKROBİYOLOJİ VE KLİNİK MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2006
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: ESRA KOYUNCU
Danışman: FAZIL ALPER TEKELİ
Özet:ÖZET Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Candida albicans ve Candida dubliniensis Suşlarının Genotiplendirilmesi ve Moleküler Yöntemlerin Tanıdaki Yerinin Araştırılması C. dubliniensis son zamanlarda tanımlanmış, fırsatçı bir patojendir. Germ tüp ve klamidospor oluşumu gibi tamsal özellikleri C. albicans ile paylaşır ve genellikle standart tamsal yöntemlerle C. albicans olarak yanlış sınıflandırılır. Klinik infeksiyonlarda C. dubliniensis'' in rolünün daha iyi anlaşılması için mikrobiyoloji laboratuvarlarında bu türün klinik örneklerden hızlı ve doğru olarak tanımlanabilmesi gereklidir. Etkenin genotiplendirilmesi epidemiyolojik çalışmalar, uygun tedavi ve korunma protokollerinin geliştirilmesi açısından önemlidir. Bu çalışmada çeşitli klinik örneklerden elde edilen germ tüp pozitif 84 suş C. dubliniensis'' in klamidospor oluşturma, 45°C'de ürememe, Staib agar besiyerinde R koloni oluşturma, CHROMagar Candida besiyerinde koyu yeşil koloniler oluşturma ve karbonhidrat kullanımı gibi fenotipik özellikleri açısından incelenmiştir. Fenotipik olarak C. dubliniensis' e benzeyen 6 suş elde edilmiştir. Ancak fenotipik testler suşlarm hepsinde kesin ve doğru sonuç vermediğinden ve gözlemciye bağlı olarak değişiklikler gösterebildiğinden PCR ya da diğer moleküler yöntemlerle tanımlamanın doğrulanması önerilmektedir. Fenotipik olarak C. dubliniensis^ e benzeyen suşlann PCR ve PCR/RFLP incelemeleri sonucunda C. dubliniensis olduğu kesin olarak belirlenmiştir. PCR/RFLP' nin klinik örneklerden izole edilen C. dubliniensis suşlannı tanımlamada da yararlı olduğu gözlenmiştir. M 13 primeri kullanılarak C. albicans suşlanndan C. dubliniensis suşları ayırtedilebilmiştir. ERIC2 primeri kullanılarak C. albicans suşlanndan C. dubliniensis suşlannı ayırtedebilmek için daha fazla çalışmaya ihtiyaç duyulmaktadır. Genotipik yöntemler fenotipik yöntemlere göre daha kısa zaman almaktadır. Elde edilen 78 C. albicans ve 6 C. dubliniensis susunun Mİ 3 primeri ve ERIC2 primeri kullanılarak yapılan genotiplendirilmesi sonucunda; M 13 primeri kullanılarak C. dubliniensis suşlarının tanımlanabileceği, C. dubliniensis' i genotiplendirmede Mİ 3 primerinin ayrrım gücünün daha yüksek olduğu sonucuna varılmıştır. ERIC2 primerleri C. dubliniensis suşlannı tiplendirmede Mİ 3 primeri ile RAPD yönteminden daha düşük ayının gücüne sahiptir. Mİ 3 ve ERIC2 primerleri birlikte kullanıldığında C. albicans suşlan için daha yüksek aymm gücü elde edilmiştir, C. albicans suşlanm genotiplendirirken birden fazla yöntemin kullanılması önerilmektedir. CA-INT-R ve CA-INT-L primerleri ve CaLSU-F ve CaLSU-R primerleri kullanılarak 25 S intron analizi ile genotiplendirmenin C. dubliniensis suşlanm tanımlamada da kullanılabileceği gösterilmiş olup, intron analizi ile tiplendirimin C. albicans suşlan arasındaki epidemiyolojik araştırmalara faydalı olacağı düşünülmüştür. Anahtar sözcükler: C. albicans, C. dubliniensis, Fenotipik Tam, Moleküler Tam, Genotiplendirme 68