Afganistan popülasyonunda HBV, HCV ve HDV moleküler epidemiyolojisi


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2019

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: ABBAS ALİ HUSSEINI

Danışman: ABDURRAHMAN MİTHAT BOZDAYI

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Afganistan genel popülasyonunda HBV, HCV ve HDV epidemiyolojik durumu ve moleküler profilini belirlemek için beĢ ana bölgeden rasgele 492 birey ve daha önce rapor edilen 234 HBsAg ve 44 anti-HCV pozitif hasta çalıĢmaya dahil edilerek HBsAg, Anti-HBc, Anti-HBs, Anti-HCV ve Anti-Delta pozitifliğini eliza testi ile ve popülasyonundaki genotipleri, alt genotipleri ve alt türleri HBV Pre S, HCV NS5B ve HDAg bölgelerinin dizilenmesi ve filogenetik analizi yöntemi ile araĢtırılmıĢtır. Ayrıca, HBV pol, HBsAg ve NS5B genlerindeki klinik açıdan önemli olan varyantları da incelenmiĢtir. Anti-HBc ve HBsAg prevalensi sırasıyla % 30.28 ve % 6.3 olarak belirlenmiĢtir. Katılımcıların % 27.64'ü, Anti-HBs ≥ 10.0 mIU / mL titresi gösterirken, % 59,95'i HBV'ye karĢı duyarlıydı. Anti-HCV pozitifliği ise % 1,62 olarak tespit edilmiĢtir. HBsAg pozitif bireyler arasında Anti-HDV prevelansı % 2.5 tespit edilmiĢtir. HBV genotip D ve HDV-I'in ilgili enfeksiyonların yaklaĢık % 100'ü iken HCV genotip dağılımı % 75.86 1b, % 20.69 3a ve % 3.44 3b gösterilmiĢtir. HBsAg MHR'de Y100 (3/20), Q101 (1/20), G102 (3/20), T115 (9/20), P120 (1/20), T131 (1/20) mutant varyantlar gözlenmiĢtir. Benzer Ģekilde HBV pol geninde S213T (2/20), Q215P (1/20) ve N248H (20/20) mutasyonları saptanmıĢtır. Ayrıca C316N mutasyonu HCV 1b hastalarının % 72.7‟sınde bulunmuĢtur. Sonuç olarak, Afgan hastalarında çok az genotipik varyasyon olduğu söylenebilir. Nüfusun çoğunluğu, özellikle genç nesil, hassastır ve nüfustaki maruz kalma riski yüksektir. Anahtar kelimeler: HBV, HCV, HDV, epidemiyoloji, filogenetik, genotip.