Dermatofitlerin konvansiyonel ve maldı-tof yöntemi ile tanımlanmaları ve sıvı mikrodilusyon yöntemiyle antifungal duyarlılık profilleri


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, VETERİNERLİK MİKROBİYOLOJİSİ ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2022

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: NİHAL ALEM TEKİNASLAN

Danışman: Barış Sareyyüpoğlu

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Dermatofitler, insan ve hayvanlarda deri, tırnak ve kılların stratum corneum tabakasına yerleşerek yüzeyel keratinize dokularını infekte eden küf mantarlarıdır. Dermatofitlerin tür düzeyinde identifikasyonları konvansiyonel yöntemlerle yapılmaktadır. Dermatofitlerin tanımlanmalarında kullanılan klasik mikolojik yöntemler olan morfolojik ve fizyolojik testler uzun zaman almaktadır. Matriks Aracılı Lazer Dezorbsiyon İyonizasyon Uçuş Zamanı Kütle Spektrometresi (Matrix-Assisted Laser Desorbtion/Ionization Time-of Flight Mass Spectrometry, MALDI-TOF MS) mikroorganizmaların tanımlanmasında kullanılan hızlı ve yeni bir yöntemdir. Antifungal duyarlılık testleri ise bir antifungal ajanın belli bir mantar türüne karşı in-vitro etkinliğini saptamak amacıyla uygulanmaktadır. Bu tez çalışmasında, dermatofitlerin geleneksel yöntemler ve MALDI-TOF MS yöntemiyle identifikasyonu ve antifungal duyarlılık profillerinin incelenmesi amaçlanmıştır. Bu kapsamda incelenen 82 dermatofit izolatının konvansiyonel tanımlaması yapılmıştır. 15 adet M. canis, 23 adet T. mentagrophytes ve 45 adet T. rubrum kökeni yeniden identifiye edilmiştir ve bu dermatofit izolatlarının tümü MALDI-TOF MS yöntemiyle de doğrulanmıştır. Ayrıca 50 dermatofit suşunun sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle CLSI M38-A3'e göre amfoterisin B, itrakonazol, ketokonazol ve terbinafin için antifungal duyarlılıkları incelenmiştir. Antifungal duyarlılık çalışması yapılan 8 adet M. canis suşunun MIK aralıkları Amfoterisin B için 0,25-1, Itrakonazol için 0,015-0,25, Ketokonazol için 0,015-0,5 ve Terbinafin için <0,015-0,03, 24 adet T. mentagrophytes suşunun MİK aralıkları Amfoterisin B için 0,015-4, Itrakonazol için <0,015-2, Ketokonazol için 0,015-1 ve Terbinafin için <0,015-0,12518 adet T. rubrum suşunun MİK aralıkları Amfoterisin B için 0,25-1 Itrakonazol için 0,015-0,125, Ketokonazol için 0,015-0,5 ve Terbinafin için <0,015-0,06 olarak bulunmuştur. Klinik tanı açısından önemli ve yenilikçi bir teknoloji olan MALDI-TOF MS yöntemi, dermatofitlerin rutin laboratuarlarda hızlı ve doğru tanımlanmaları için konvansiyonel yöntemlerle birlikte kullanılmalıdır. Anahtar Sözcükler: Antifungal Duyarlılık Testleri, Dermatofit, Konvansiyonel yöntemler, MALDI-TOF MS.