Kanser ve venöz tromboz: Tümör gelişimi ile tromboz ilişkisinde koagülomun tanımlanması
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2014
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: SEMİH DALKILIÇ
Danışman: HİLAL ÖZDAĞ SEVGİLİ
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Trousseau Sendromu, malignant bir durumun öncesinde veya onunla birlikte görülen trombotik bir olayı ifade etmektedir. İlk defa 1865 yılında Armand Trousseau tarafından ifade edildiği gibi, venöz tromboz ile kanser arasında güçlü bir bağlantı mevcuttur. Bu bağlantı bir çok çalışma tarafından valide edilmiş, idiopatik venöz tromboz hastalarında kanser görülme riskinin yaklaşık 10 kata kadar arttığı belirlenmiştir. Önceki dönemlerde yapılan çalışmalarda tümör veya trombosit kaynaklı olabilen müsin veya doku faktörü gibi moleküllerin bu patolojinin ortaya çıkmasından sorumlu olduğu düşünülmekteydi. Bunlara ileveten hipoksi, onkogen aktivasyonu ve inflamatuvar sitokinler gibi başka moleküller ve mekanizmalar ileri sürülmüştür. Fakat bu bağlantının altında yatan mekanizma hala net olarak ortaya konmamıştır. Bu çalışmada, kanser ve venöz tromboz arasındaki bağlantı incelenmiş ve kanser, venöz tromboz, kanser + tromboz ve sağlıklı bireylerden oluşan grupları karakterize edebilecek bir moleküler imzanın mevcut olup olmadığı araştırılmıştır. Yapılan biyoinformatik analizler sonucunda her bir ikili karşılaştırma için farklı ifade edilen gen listeleri belirlenmiştir. Daha sonra bu gen listeleri ile yapılan ileri biyoinformatik analizler ve veri madenciliğinden sonra hiyerarşik kümeleme analizleri yapılmıştır. Verilen heatmaplerde de görüleceği üzere tüm ikili karşılaştırmalarda grupları birbirinden ayıran spesifik bir profile sahip oldukları, özellikle Kanser vs. Kontrol ve Tromboz vs. Kontrol karşılaştırmalarında bu durumun daha net olduğu görülmüştür. Yapılan yolak analizlerinde özellikle kanser yolağı, lökosit transendotelyal göç yolağı, aktin hücre iskelet regülasyon yolağı ve akson yönlendirme yolağı, prostat kanser yolağı gibi yolakların öne çıktığı tespit edilmiştir. Yolak analizlerinden sonra QRT-PCR validasyonu için bir aday gen listesi belirlenmiştir. CASPASE 8, CEACAM8, IKBKB ve HASP90B1 genleri istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur. Yaptığımız bu çalışma ile bu 4 farklı grubun ifade profillemesinde farklı moleküler imzaya sahip olduğunu ve CASPASE 8, CEACAM8, IKBKB ve HASP90B1 genlerinin aday moleküler biyomarkır olarak kullanılabileceği gösterilmiştir. Ancak bu genlerin daha fazla sayıda örnek içeren farklı bir örnek grubunda valide edilmesi gerekmektedir.