Miyeloproliferatif neoplazilerde (MPN) JAK2 ve MPL gen mutasyonlarının patoloji arşiv materyalleri kullanılarak saptanmasında yeni nesil dizileme teknolojilerinin yeri

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2013

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: ŞENAY BOYACIGİL

Danışman: IŞINSU KUZU

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu çalışmada patoloji arşiv materyalinden elde edilen DNA örnekleri ile yeni nesil dizileme teknolojileri kullanılarak JAK2 ekzon 12 ve ekzon 14 (JAK2V617F) ve MPL ekzon 10 (MPLW515L, MPLW515K, MPLA506T ve MPLA519T) mutasyonlarının araştırılması ve patoloji arşiv materyallerinde mutasyonlu hücre oranı hastalık prezentasyonu ilişkisinin tespitinde yeni nesil dizileme teknolojilerinin duyarlılığı araştırılmıştır. . Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Patoloji Anabilim Dalı'da 2001-2011 yılları arasında kemik iliği biyopsi ve yayma preparatları incelenen BCR ABL negatif MPN (ET, PV, PMF) tanısı almış hastalar çalışmaya alınmıştır. JAK2 ve MPL mutasyonlarını saptamak amacıyla yeni nesil dizileme (pirosekanslama) yöntemi kullanılarak moleküler analiz gerçekleştirilmiştir. Yaş, cinsiyet dağılımları ile laboratuvar bulguları hastalıkların evreleriyle beklenen sınırlar içeriside bulunan serimizde tüm olguların % 76.5'inde JAK2 ekzon 14 V617F mutasyonu bulunduğu ve % 23.5 olgunun yabanıl tip olduğu saptanmıştır. JAK2 ekzon 12 mutasyonu hiç bir olguda saptanmamıştır. MPL ekzon 10 mutasyonu ise sadece 1 ET tanılı olguda (% 2.9) saptanmıştır. ET (% 75) ve PMF (% 75) tanı gruplarında JAK2V617F mutasyonu klasik kaynaklarda bildirildiğinden daha yüksek oranda, PV (% 78,6) olgularında ise daha düşük oranda bulunmuştur. JAK2V617F-pozitif klonunun büyüklüğü anlamında olan "Allel burden" oranı en düşük PMF olgularında, bunu izleyen oranda ET ve en yüksek PV olgularında bulunmuştur. Sellülarite ve kan lökosit düzeyleri ile allel burden oranı arasında anlamlı ilişki saptanmıştır. Bu çalışmada kemik iliğindeki tüm farklı klonları içeren materyallerde, yeni nesil dizileme teknolojisinin metot olarak tercih edilmesindeki en önemli avantajlarından biri olan allel burden durumunuun yüksek hassasiyet ile tespit edilebildiği görülmüştür.