Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2022
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: SELDA DURAN YELKEN
Danışman: Feray Alkan
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:
Bovine Leukemia Virusun Env, LTR ve pX Gen Bölgelerinin Moleküler Analizi Bu çalışmada, ülkemizdeki sığırlarda tespit edilen Bovine Leukemia Virus’un (BLV), env, LTR ve pX gen bölgesi dizinlerinin elde edilerek, var olan genotiplerin saptanmasının yanısıra, çalışmadaki virus dizinlerinin diğer BLV suşlarının dizinleri ile karşılaştırılması sonucunda tespit edilen mutasyonların, farklı enfeksiyon tablolarının oluşumu ve olası patogenetik mekanizmalar üzerine etkisiyle ilgili değerlendirmeler yapılması amaçlanmıştır. Bu amaçla, Türkiye’nin çeşitli illerindeki sığır işletmelerinden temin edilen ve önceki çalışmalarda ELISA ile BLV’ye karşı antikor varlığı saptanan hayvanlara ait 179 retrospektif kan örneği moleküler analizler için kullanılmıştır. Örnekler, sahada sirküle olan genotip(ler)i ve olası mutasyonları tespit etmek amacıyla PCR ile env gen bölgesi yönünden test edilmiştir. BLV env gen bölgesi pozitif tespit edilen 126 adet örneğin 57’sinin kısmi env gen dizinleri elde edilerek yapılan filogenetik analizler sonucunda, çalışmadaki tüm yerel virusların genotip 1 (G1)’de yer aldıkları tespit edilmiştir. LTR ve pX gen bölgesi yönünden test edilen ve pozitif bulunan örneklerden ise 48 örneğin LTR gen bölgesi, 33 örneğin pX gen bölgesi dizinleri elde edilmiştir. Elde edilen nükleik asit ve amino asit dizinleri incelenerek yerel viruslarda saptanan, transaktivasyon ve patogenez ile ilgili olduğu bildirilen mutasyonlara yönelik değerlendirmeler yapılmıştır. Araştırmacılar tarafından bildirilen bu değişimlerin bir kısmının bu çalışmadaki yerel viruslarda da var olduğu tespit edilmiştir. Bu çalışma ile Türkiye’deki BLV’lerin LTR ve pX gen bölgesinin moleküler analizi ilk defa bildirilmiştir.