Plazma hücre farklılaşması gösteren düşük dereceli B hücreli lenfomalarda MYD88 l265P mutasyonunun dağılımı
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2015
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: SHAGHAYEGH REZAPOURBEHNAGH
Danışman: IŞINSU KUZU
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Nokta mutasyonu olan MYD88 L265P ∼%90 Lenfoplazmasitik Lenfoma (LpL) / Waldenström Makroglobulinemi (WM) ve / veya tanı olarak belirsiz immünoglobulin M (IgM) monoklonal gamopati vakalarda (MGUS) bildirilmiştir. Bu mutasyon LPL / WM için spesifik olmamakla birlikte diğer laboratuar ve klinik verilerle rutin uygulamalarda ayırıcı tanıda kullanılabilir. Bir sorun olarak mevcut numune içinde neoplastik hücrelerin miktarı hassasiyet etkilemektedir. Başka bir sorun DNA parçalanması veya kalitesidir etkileyen dokuların formalin fiksasyonudur. Farklı yöntemler mutasyon analizi için gerçekleştirilebilir. DNA dizileme metodu allel yükü % 20-30 daha az ise mutasyonu kaçırma olasılığı mümkündür. RT-PCR yöntemi daha duyarlı ve % 1 sınırı içinde hedef nokta mutasyonları tarama özelliği vardır. Bu çalışmada amacımız, plazma hücre farklılaşması gösteren B hücreli lenfomalarda MYD88 mutasyon dağılımı, mutasyona tespiti için kullanılan arşiv preparatlarda DNA kalitesi ve doku tespit işlemlerin etkisini incelenmiştir. RT-PCR ve dizi analizleri sonuçlarını karşılaştırarak, %70 oranda RT-PCR pozitif vakalarda dizi analizi yöntemiyle yakalamak mümkün olmamıştır. MYD88 (L265P) mutasyonu (% 91) 11/12 WM, (% 27) 3/11 NMZL ve (% 20) 2/10MZL NOS ve (% 10) 2/19 SMZL hastada ile saptandı. İki yöntem arasındaki mutasyon tespit farkı bulunmasının en önemli faktörleri DNA konsantrasyonu (p = 0.034) ve kullanılan materyal türü (FFP/Yayma) (p = 0.008) bulunmuştur. Bu çalişmada mutasyon tespiti başarısı için bağımsız bir faktör olarak tümör yükü bulunmadı. Yapılan çalışmanın sonuçlarını kullanarak güvenilir mutasyon sonuçları için daha hassas yöntemler ve korumalı patolojik materyal en önemli faktörler olduğunu onaylanmış.