Nokta mutasyonlarının saptanmasında yüksek çözünürlüklü erime tekniğinin verim ve hassasiyetinin değerlendirilmesi

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2008

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: HÜLYA SÜMER

Danışman: HİLAL ÖZDAĞ SEVGİLİ

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Mutasyon DNA dizisinde meydana gelen kalıcı değişimdir. DNA'daki sekans varyasyonlarının saptanması hem kalıtımsal hem de genetik hastalıkların teşhisinde büyük önem taşır. Mutasyonların tarama ve saptanması amacıyla birçok yöntem geliştirilmiştir. Bunlardan biri de HRM'dir (Yüksek Çözünürlüklü Erime). HRM, amplifiye edilen DNA örneklerinin sıcaklık artışıyla birlikte çift zincirli DNA'dan tek zincirli DNA'ya dönüşümündeki ayrılma davranışının karakterize edilmesi esasına dayanır. Mutasyon tarama ve saptanmasında en güvenilir tekniklerden biri olarak öne çıkan DHPLC ise HRM'ye benzer şekilde amplifiye edilmiş DNA fragmentinin erime profilinin olası bir mutasyon varlığında değişimini kromatografik olarak tespit etmektedir.Bu çalışmada HRM ve DHPLC'nin nokta mutasyonlarını saptamadaki verim ve hassasiyeti değerlendirilmiştir. Bu amaçla MEFV (E148Q, M680I, M694V, V726A), Faktör V (1691G>A) ve Protrombin (20210G>A) genleri ile çalışılmıştır.Çalışmamız HRM'nin nokta mutasyonlarının tespitinde en az DHPLC kadar hassas ve güvenilir bir yöntem olmasının yanı sıra işlem hacmi, süre ve maliyet açısından da DHPLC'den daha verimli olduğunu ortaya koymuştur.