Yerel Mavidil virusu izolatlarının Plak Redüksiyon Nötralizasyon (PRN) ve Reverz Transkriptaz Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RT-PZR) teknikleri ile serotipik identifikasyonu

---

Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, VİROLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2009

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: VOLKAN YILMAZ

Danışman: AYKUT ÖZKUL

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu çalışmada 1998-2005 yılları arasında izole edilen yerel BT viruslarının serotipik identifikasyonu amaçlanmıştır. Bu amaç için jenerik ve serotip spesifik RT-PZR sistemleri ile PRN testi tasarlanmıştır. Jenerik RT-PZR segment 10 düzeyinde daha önce bildirilen (Nikolakaki ve ark., 2005) primerler kullanılarak gerçekleştirilirken, sRT-PZR segment 2 düzeyinde ve serotip 2 ve 4 için daha önce Mertens ve ark. (2007) tarafından, serotip 9 ve 16 için ise bu çalışma kapsamında tasarlanan primerler kullanılarak gerçekleştirildijRT-PZR ile araştırma kapsamında çalışılan 26 adet BTV izolatının tamamında Seg-10 spesifik DNA ürünleri elde edilebilmiştir. Diğer taraftan sRT-PZR uygulaması sonunda ise izolatlardan 19 adedi serotip 9 ve 1 adedi serotip 16 olarak identifiye edildi. sRT-PZR sonunda serotip 2 ve 4 primerleri ile herhangi bir DNA ürünü elde edilemediMoleküler identifikasyon verileri kullanılarak PRN testinin ana komponenti olan tip spesifik hiperimmun serumların elde edilmesi için 3 referans virus (BTV-4, BTV-9 ve BTV-16) tavşanlara inokule edildi. İnokulasyon takvimi sonunda hiperimmun serumlarda her 3 virusa karşı 1:10 düzeyinde nötralizan antikor titresi belirlendi. Bu serumlar kullanılarak yapılan PRN testi sonunda 19 izolat BTV-9, 1'er izolat BTV-4 ve BTV-16 olarak identifiye edildiSonuç olarak RT-PZR direkt olarak laboratuar ve kullanıcı profillerinden etkilense de sRT-PZR ve PRN testleri arasında BT virusu serotiplerinin tanısı açısından benzer duyarlılık tespit edildi.