Ruminantları Enfekte Eden Pestivirusların Ayırıcı Tanısı ve MolekülerKarakterizasyonu
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, VİROLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2022
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: ONUR ÜLGENALP
Danışman: Tuba Çiğdem Oğuzoğlu
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Pestiviruslar, sığırlarda Bovine Virus Diarrhoea Virusu (BVDV) ve küçük ruminantlarda Border Disease Virusu (BDV) olmak üzere klasik viral taksonomide adlandırılmışlardır. Sürü sağlığı ve devamlılığı yönünden önem arz eden bu viruslar abortlar, kongenital anomalili ve yaşama gücü zayıf yavru doğumları ile karakterize ekonomik kayıplara sebep olan viral etkenler arasında yer almaktadırlar. Bu doktora tezi; ülkemizde bulunan ruminant türlerinde klinik/subklinik enfeksiyonlara neden olan Pestivirus enfeksiyonlarından Bovine Viral Diarrhoea (BVD), Border Disease (BD) ve Mucosal Disease (MD) enfeksiyonlarının moleküler metotlarla araştırılmasına yöneliktir. Elde edilen bulgular uygulanan tanı metodu türleri baz alınarak sorgulanmış, ayrıca pozitif örnekler filogenetik olarak da karakterize edilmiştir. Ülkemizin Marmara Bölgesi'nden ve Avrupa Ülkelerinden köken alan hayvanlardan elde edilen izolatların karakterizasyonunda, Pestivirus genomunun 5'UTR, Npro, E ve NS2-3 bölgelerine yönelik primerler kullanılmış elde edilen sonuçlar dünyadaki ve Türkiye'deki hem cinsleri ile karşılaştırılmıştır. Saptanan 61 adet pozitif numuneden elde edilen amplikonlar dizin analizine tabi tutulmuştur. İlgili dizinler Gen Bankasına kaydedilmiş olup, aynı zamanda dünyadaki hem cinsleri ile filogenetik analizler kullanılarak karşılaştırılmıştır. Bu bağlamda Pestivirus A, Pestivirus B, Pestivirus D ve Pestivirus I türleri tespit edilmiştir. Bu çalışmada Pestivirus D ve Pestivirus I türlerinin büyük ruminantlarda varlığı belirlenmiş olmakla birlikte Pestivirus A türüne ait BVDV-1f ve 1l alt türlerinin küçük ruminantlarda varlığı da tespit edilmiş ve bu sonuçlara bağlı olarak Pestivirusların türler arası geçiş özelliği gösterilmiştir. Elde edilen bulgular Veteriner Viroloji alanında Ruminant orijinli Pestiviruslar hakkında moleküler bilgiye katkı sağlamakla birlikte ileride yapılması muhtemel ulusal eradikasyon ve aşılama programları için kaynak teşkil edecektir.