Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2018
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: SİNEM UĞUR
Danışman: MUSTAFA AKÇELİK
Özet:Bu çalışmada 4 farklı Salmonella serovaryetesinde, seqA geninin Salmonella biyofilmlerinin yapısal ve foksiyonel özellikleri üzerine etkileri araştırıldı. Salmonella suşlarının seqA delesyonlu mutantları Lambda red rekombinaz sistemi kullanılarak elde edildi. Doğal Salmonella suşları ve onların seqA mutantları biyofilm oluşturma kapasiteleri açısından karşılaştırıldığında, seqA mutantlarında biyofilm oluşumunun istatistiki açıdan anlamlı bir şekilde azalıdığı saptandı (p<0,01). Doğal ve mutant suşların oluşturduğu biyofilmlerin morfotipi agar plakları üzerinde incelendiğinde; S. Virchow DMC11 doğal suşunda RDAR olarak tespit edilen biyofilm morfotipinin BDAR’a, doğal biyofilm morfotipi RDAR olan S. Typhimurium suĢlar DMC4, S. Enteritidis 31 ve S. Typhimurium 14028 suĢlarının seqA mutantlarında ise PDAR’a dönüştüğü saptandı. Aynı suşlar ve onların seqA mutantlarının sıvı hava ara fazında pelikül oluşturma özellikleri incelendiğinde, seqA geninin pelikül oluşumu ve peliküllerin yapısal özellikleri üzerinde etkili olduğu belirlendi. Doğal suĢ ve mutantların çelik ve polistiren yüzeylerde biyofilm oluĢturma özellikleri incelendiğinde de, seqA mutantlarında biyofilm üretme yeteğinin istatistiki açıdan anlamlı (p<0,01) oranlarda düştüğü tespit edildi. Son olarak; gerçek zamanlı kantitatif PZR denemeleri ile seqA geninin ifadesinin, biyofilm oluşumunda etkin bir role sahip olan csgD, csgA ve bcsA genlerinin ifadeleri üzerinde pozitif etki göstediği saptandı. In this study, the effects of seqA gene on the structural and functional properties of Salmonella biofilms were investigated in 4 different Salmonella serovars. seqA gene deletion mutants of Salmonella strains were obtained using the Lambda red recombinase system. When wild type Salmonella strains and their seqA mutants were compared in terms of biofilm formation capacities, biofilm formation in the seqA mutants was statistically significantly reduced (p <0.01). The end of the morphotype comparisans of the biofilms formed by wild type and mutant strains; The biofilm morphotype identified as RDAR in the wild type S. Virchow DMC11 was converted to BDAR; S. Typhimurium DMC4, S. Enteritidis DMC31, and S. Typhimurium 14028 strains, which are natural biofilm morphotypes RDAR, were converted to PDAR in the seqA mutants. Examining the ability of the same strains and their seqA mutants to form pellicles in the liquid-air interphase, it was determined that the seqA gene influences the formation of the pellicle and the structural properties of the pellicles. When biofilm formation properties of wild type and their mutants on steel and polystyrene surfaces were examined, it was found that the biofilm production rate in the seqA mutants was reduced statistically significant (p <0.01) rates. Finally; real time quantitative PCR experiments revealed that the expression of the seqA gene had a positive effect on the expression of csgD, csgA and bcsA genes, which have an active role in biofilm formation.