Piliç karkaslarına ait boyun derilerinde termofilik campylobacter türlerinin varlığı ve C. jejuni'nin PCR tekniği ile saptanması


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2006

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: AHMET KOLUMAN

Danışman: HAYDAR ÖZDEMİR

Özet:

Piliç Karkaslarına Ait Boyun Derilerinde Termofilik Campylobacter Türlerinin Varlığı Ve C. jejuni'nin PCR Tekniği ile Saptanması Bu çalışmada, piliç kesimhanelerinde yeni kesilmiş piliç karkaslarından alınan piliç boyun derileri ve bağırsak içeriği ile piliçlerin kesimhaneye getirildiği kümeslerden alınan yem ve su örneklerinde termofilik Campylobacter türlerini kültür tekniği ile belirleyerek, C. jejuni olarak saptanan suşların, PCR tekniği ile doğrulanması amaçlanmıştır.Bu amaçla, iki farklı piliç kesimhanesinden sıcak aylar (mayıs, haziran, temmuz, ağustos) ve soğuk aylarda (kasım, aralık, ocak, şubat) 160 adet piliç boyun derisi, 160 adet bağırsak içeriği ile 32'şer adet yem ve su örneği olmak üzere toplam 384 örnek alınmıştır. Alınan tüm örneklerde, termofilik Campylobacter türlerinin izolasyon ve identifikasyonunda zenginleştirme işlemine dayalı ISO (The International Organization for Standardization, 10272) yöntemi kullanılmıştır. Çalışma sonucunda, 384 örneğin 248'sinin (% 64.58) termofilik Campylobacter türleri ile kontamine olduğu saptanmıştır. Alınan örneklerde termofilik Campylobacter türlerinin dağılımı incelendiğinde, 160 boyun derisi örneğinin 138'inin ( % 86.25), 160 bağırsak içeriği örneğinin 106'sının (% 66.25) ve 32 su örneğinin 4'ünün (% 12.5) termofilik Campylobacter türleri ile kontamine olduğu saptanmıştır. ncelenen 32 adet yem örneğinin hiçbirinde (% 0) ise termofilik Campylobacter türleri bulunamamıştır. C. jejuni ise alınan 384 örneğin 207'sinde (% 52.34) saptanmış olup, örnek bazında 160 boyun derisinin 122'sinde (% 76.25), 160 bağırsak içeriğinin 82'sinde (% 51.25) ve 32 suyun 3'ünde (% 9.38) saptanmıştır. C. jejuni sıcak aylarda alınan 176 örneğin 116'sınında (% 65.90) bulunmasına karşın, soğuk aylarda alınan 176 örneğin 91'inde (% 51.70) saptanmıştır. statistiksel yönden yapılan analizde de, mevsimsel farklılığın önemli olduğu (P<0.05) belirlenmiştir. Çalışmanın ikinci aşamasında, klasik kültür tekniği ile C. jejuni olarak belirlenen suşların, PCR tekniğiyle doğrulanması yapılmıştır. Bu amaçla, klasik kültür tekniğinde C. jejuni olarak belirlenen toplam 207 suşun, PCR tekniğinde 171'inin (% 82.00) C. jejuni olduğu doğrulanmıştır. Sonuç olarak, piliç kesimhanelerinde yeni kesilmiş piliç karkaslarından alınan piliç boyun derileri ve bağırsak içeriklerinin yüksek düzeyde C. jejuni ile kontamine olduğu ortaya konulmuştur. Bu nedenle çiftlikten masaya gıda güvenliği kapsamında, kümes hijyeni ve kesim hijyeninin sağlanması için, kanatlı sektöründe HACCP ve GMP sistemlerinin uygulanması, meydana gelecek C. jejuni kontaminasyonunu kontrol etmeye yardımcı olacaktır. AbstractOccurrence Of Thermophilic Campylobacter Species On Chicken Neck Skins Taken From Poultry Slaughterhouse And Confirmation Of C. jejuni Isolates Using PCR Technique This study was designed to determine the presence of thermophilic Campylobacter spp. using the conventional cultural technique from neck skin, intestinal contents of slaughtered chickens, and water, feed samples of same flock taken at the farm level. C. jejuni strains obtained using conventional cultural technique were confirmed using the PCR technique. For this purpose totally 384 samples consisting of 160 chicken neck skin, 160 intestinal content, 32 feed, and 32 water samples obtained from two different slughterhouses on relative warm months (May, June, July, August) and relative cold months (November, December, January, February). In all samples, isolation and identification of thermophilic Campylobacter spp. held using the enrichment based ISO (The International Organization for Standardization, 10272) method. The contamination with thermophilic Campylobacter spp. was detected in 248 (64.58 %) of 384 samples. Thermophilic Campylobacter spp. contamination on neck skin, intestinal content, and water samples were 86.25 %, 66.25 %, and 12.5 % respectively. None of the 32 feed samples were found to be contaminated with thermophilic Campylobacter spp. C. jejuni contamination detected in 207 ( 52.34 %) of 384 samples. The distrubution of C. jejuni contamination in samples were, 122 (76.25 %) of 160 neck skin, 82 (51.25 %) of 160 intestinal content, 3 (9.38 %) of 32 water samples. Totally 176 samples were taken in hot months, and 116 (65.90 %) were found to be contaminated with C. jejuni. On the other hand 91 (51.70 %) of 176 samples taken on cold months were found to be contaminated with C. jejuni. These results statistically indicate a significant seasonal difference (P < 0.05). At the second step of the study, C. jejuni strains obtained using conventional cultural technique were confirmed using PCR technique. PCR confirmation of strains showed that 171 (82.00 %) of 207 strains were confirmed as C.jejuni. The results of this study indicate that chicken neck skins and intestinal contents of newly slaughtered chickens are contaminated with C. jejuni. Due to the results obtained from this study showed that, of chicken meat from farm to table, maintanence of flock hygiene and slaughter hygiene with application of HACCP and GMP systems will help control of C. jejuni contamination.