Türkiye'deki karacalarda (Capreolus Capreolus) mitokondriyal DNA dizi varyasyonu

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, BİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2014

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: ALİ ONUR SAYAR

Danışman: İRFAN KANDEMİR

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu çalışmanın temel amacı ülkemizin önemli otçul memelilerinden karaca (Capreolus capreolus Linnaeus, 1758) populasyonlarının filogenetik durumu ve genetik çeşitlilik açısından hem Türkiye hem de dünyadaki konumunun araştırılmasıdır. Bu bağlamda Ulusal DNA ve Hücre Bankasını oluşturma projesi için Türkiye'nin çeşitli bölgelerinde av turizmi kapsamında vurulan veya yavru/yaralı/ölü ele geçen 20 tane karaca bireyinden alınan kan ve kas örneklerinden DNA elde edilmiştir. Bu DNA'ların mitokondriyal sitokrom b genine özgün prımerler kullanılarak 266 bazlık kısmı PZR yöntemiyle çoğaltılmıştır. Bu dizilerden 4 tane haplotip elde edilmiştir. Haplotip çeşitliliği 0,6053, nükleotit çeşitliliği ise 0,00265 bulunmuştur. 3 haplotipin, HAP1 adı verilen haplotipten birer baz değişikliği ile türediği tespit edilmiştir. Türkiye ve Avrupa'daki karaca popülasyonlarının karşılaştırılabilmesi için Avrupa'ya ait cyt-b dizileri GenBank'tan elde edilmişti. Bu haplotiplerden Fransa haplotipi HAP1 ile birebir örtüşmektedir. En uzak haplotip ile 11 baz farklılığı vardır. . Bu haplotiplerle Neigbour Joining, Maximum Likelihood ve Median Joining ağaçları oluşturulmuştur. Türkiye ve Polonya popülasyonları karşılaştırıldığında ikili farklılıkların yüksek olmadığı, gen akışı değerlerinin ise düşük olduğu gözlenmiştir