Kesimhanelerdeki sığır karkaslarında clostridium perfringens'in varlığı ve moleküler tiplendirilmesi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, GIDA HİJYENİ VE TEKNOLOJİSİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2018
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: MERİÇ PELİN TUNALI GÖKALP
Danışman: ÖZLEM KÜPLÜLÜ
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Clostridium perfringens, Clostridiaceae ailesinin Clostridium genusunda yer alan Gram pozitif, çubuk şeklinde, sporlu, fakültatif anaerob, hareketsiz ve ubiquiter patojen bir bakteridir. Etkenin patojenitesi insanlar ile evcil ve yabani hayvanların bağırsaklarında ürettiği toksinlerden ileri gelmektedir. C. perfringens'in ürettiği toksinler; major (alfa (α), beta (β), epsilon (ε) ve iota (ι) toksin) ile minör (enterotoksin (cpe) ve beta 2 (β2) toksin vb.) olarak iki farklı sınıfa ayrılmaktadır. Alfa toksin bütün tipler tarafından sentezlendiğinden etkenin doğrulanması amacıyla da kullanılmaktadır. Bu çalışmada Ankara civarındaki bir mezbahadan sığırlarda C. perfringens varlığı ve toksin tiplendirmesi amacıyla 120 karkas svap örneği toplandı. Klasik kültür yöntemiyle mikrobiyolojik ve biyokimyasal analizler sonrasında identifiye edilen izolatlar real-time PCR yöntemi ile C. perfringens α toksin geni (cpa) varlığı ile doğrulandı. İzolatlardan cpa geni içerenler multipleks PCR yöntemi ile diğer toksin genleri (cpb, cpb2, etx, iA, cpe) varlığı yönünden analiz edildi. Daha sonra bu izolatların antibiyotik duyarlılıkları belirlendi. Analizler sonucunda 120 sığır karkasından 63'ü (% 52,5) cpa genine sahip olup C. perfringens olarak tespit edilmiştir. Multipleks PCR ile 127 izolatın yalnızca birinde (% 0,78) beta2 geni saptanmıştır. Ayrıca sığır karkaslarında tespit edilen C. perfringens için sülfonamid ve tetrasiklin antibiyotik direnci öne çıkmıştır. Anahtar Sözcükler: Antibiyotik, Clostridium perfringens, Karkas, PCR, Sığır.