Ankara'daki çeşitli hastanelerde değişik yöntemler ile toksin pozitifliği saptanan dışkı örneklerinden elde edilen Clostridium difficile izolatlarının toksin genlerinin araştırılması, pcr ribotiplendirimi ve ribotipler ile antimikrobiyal duyarlılıkları arasındaki ilişkinin ortaya çıkarılması
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2015
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: EMRAH SALMAN
Danışman: Zeynep Ceren Karahan
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Clostridium difficile günümüzde en yaygın nozokomiyal enfeksiyonlardan birisidir. Yüksek düzeyde toksin üreten hipervirülan C. difficile suşları (PZR ribotip 027) daha yüksek sporlanma oranı ve florokinolonlara direnç ile karakterizedir. C. difficile PZR ribotip 027 nedeniyle oluşan enfeksiyon ayrıca daha yüksek morbidite ve mortalite, komplikasyonlar ve relaps oranları ile seyretmektedir. C. difficile PZR 027 veya oldukça patojenik suş etkilenmemiş bir ülkeye giriş yapmışsa, ağır bir C. difficile bir salgınına yol açmadan önce identifiye edilmelidir aksi takdirde kolektomilere, ölümlere ve sağlık servislerinde olağanüstü maliyetlere neden olabilmektedir. Etkilenmemiş ülkelerde riski azaltmak ve gelecek salgınların sonuçlarını hafifletmek için kanıta dayalı bir yaklaşım ile etkenin araştırılmasına yönelik sürveyans çalışmaları uygulanmalıdır. Bu amaçla Ankara'daki çeşitli hastanelerde (AÜTF ve HÜTF hastaneleri) yatan ve ishal şikayeti olan hastalardan C. difficile enfeksiyonu şüphesi ile özel laboratuvara (DLG) gönderilen dışkı örnekleri toplanmıştır. Dışkı örneklerinden C. difficile izolasyonunu takiben elde edilen kökenlerden DNA ekstraksiyonu yapılmış ve antimikrobiyal duyarlılıkları ve toksin genleri varlığı araştırılmıştır. Suşların hepsinin vankomisin ve metronidazole duyarlı olduğu saptanmıştır. Üç izolatın moksifloksasin için MİK değerleri >4µg/ml olarak belirlenmiş ve dirençli kabul edilmiştir. Bir izolat klindamisine dirençli bulunurken (MİK değeri >256 µg/ml), iki izolatta eritromisin direnci (MİK değeri >256 µg/ml) tespit edilmiştir. On yedi izolatın klindamisin için MİK değeri 2-8 µg/ml olarak belirlenmiş ve orta duyarlı kabul edilmiştir. Beş izolatın eritromisin için MİK değeri 2-8 µg/ml olarak belirlenmiş ve orta duyarlı kabul edilmiştir. Suşların hepsi tcdA ve tcdBgenleri pozitif bulunmuştur. Altmış bir C. difficile suşunun birinde(%1,6) cdtA ve cdtB genleri tespit edilmiştir. tcdCgeninde C. difficile PZR ribotip 027 için tanımlanmış delesyon ve diğer nadir tek nükleotit polimorfizmlerinin varlığının araştırılması için iki yönlü DNA dizi analizi gerçekleştirilmiş ve birinde 54 bç'lik bir delesyon saptanmıştır. Ayrıca 12 suşta çeşitli tek nükleotid polimorfizmleri saptanmıştır. Değerlendirilen suşlar içerisinde PZR ribotip 027'ye rastlanılmamıştır ancak ülkemizde ilk hipervirülan suş tespit edilmiştir. Anahtar Kelimeler: Clostridium difficile, antimikrobiyal direnç, gradyent test, toksin genleri, ribotip