Denizli tavuk populasyonunda mitokondriyal DNA D-loop polimorfizmi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2010

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: HULUSİ OZAN TAŞKESEN

Danışman: MEHMET ALİ YILDIZ

Özet:

Bu çalışmada, Türkiye yerli gen kaynaklarından Denizli tavuk ırkında mitokondriyal DNA (mtDNA) D-loop bölgesi bakımından genetik varyasyon araştırılmıştır. Araştırmada Denizli tavuk ırkına ait mensup toplam 20 tavuk ve 10 horoz kanı materyal olarak kullanılmıştır. Denizli tavuk ırkında mtDNA D-loop bölgesinin DNA dizi analizi sonucunda yaygın olarak iki farklı haplotip tespit edilmiştir. Denizli ırkında belirlenen haplotipler ile yabani orman tavuğu (RJF) alt türlerinden G. g. gallus, G. g. bankiva, G. g. spadiceus, iki farklı Beyaz Leghorn, Plymouth, Silky, New Hampshire Red, Laos, Shamo ve Türkiye yerli tavuk ırklarından Gerze tavuk ırkları arasındaki filogenetik ilişki ortaya konmuştur. MtDNA D-loop bölgesi bakımından Denizli ırkı ile diğer ırklar arasındaki genetik farklılık 0.000 – 0.016 arasında hesaplanmıştır.Abstract In this study, genetic variation on D-loop region of mtDNA was carried out in Turkish native chicken Denizli. Total of 30 Denizli chicken (20 female, 10 male) were evaluated in this research. Especially two haplotypes were determined in Denizli chicken breed based on the sequencing of mtDNA D-loop region. Phylogenetic relationship between the haplotypes determined in Denizli chicken breed and Red Jungle Fowl (RJF) subspecies G. g. gallus, G. g. bankiva, G. g. spadiceus, two different White Leghorn, Plymouth, Silky, New Hampshire Red, Laos, Shamo and Gerze chicken breed was represented. Genetic distances between Denizli and other breeds regarding mtDNA D-loop region calculated between 0.000 – 0.016.