Ruminantlarda Listerial abortların tanısı için PCR tekniklerinin optimizasyonu


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, VETERİNERLİK MİKROBİYOLOJİSİ ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2015

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: AMER TALİÇ

Danışman: BARIŞ SAREYYÜPOĞLU

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Ülkemiz hayvancılığında ruminant yetiştiriciliğinin önemli bir yeri bulunmaktadır. Ruminant yetiştiriciliğinde görülen en önemli problemlerden birisi yavru atmadır. Ülkemizde ruminantlarda abortusa neden olan bakteriyel hastalıklar arasında en sık rastlananlardan birisi de Listeriozis'tir. Yavru atmaya neden olan başlıca patojen Listeria türleri L. monocytogenes ve L. ivanovii'dir. Bu çalışmada, ruminantlarda patojen Listeria türlerinin (Listeria monocytogenes, Listeria ivanovii) neden olduğu yavru atmaların tanısında kullanılmak üzere bir multiplex-PCR tekniği geliştirilmiştir. Tekniğin sadece bakteri sulandırmalarıyla belirlenen deteksiyon limiti 3 CFU/25 µl iken, yapay kontamine dokulardaki deteksiyon limiti 75-750 CFU/25 µl arasında değişmiştir. Multiplex-PCR tekniği fötal mide içeriği, fötal karaciğer ve kotiledon örneklerinde L. ivanovii'yi L. monocytogenes'e oranla daha hassas olarak saptamış, etkenlerin saçılımının araştırılmasında ideal örneklerden biri olması nedeniyle yapay kontaminasyon çalışmalarına dahil edilen süt örneklerinde ise geliştirilen teknikle her iki etken de eşit duyarlılıkla saptanmıştır. Ruminant abortuslarına neden olan Listeria türlerinin moleküler tanısında multiplex-PCR tekniğinin kullanılmasına ilişkin bir literatüre rastlanmamış olması nedeniyle tez çıktılarının orijinal olduğu düşünülmektedir. Anahtar Sözcükler: Abort, identifikasyon, Listeria, multiplex-PCR, teşhis.