Salmonella enterica serovar Typhimurium marT mutantlarının biyofilm oluşturma özellikleri açısından doğal tip s. Typhimurium 14028 ile karşılaştırılması


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2013

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: BURCU YENER İLÇE

Danışman: NEFİSE AKÇELİK

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

MarT regülatör proteininin in-vitro kültür koşullarında S. Typhimurium'da biyofilm üretimi üzerine etkisinin araştırıldığı çalışmada; MarT protein üretiminin en yüksek düzeyde teşvik edildiği ardışık iki arabinoz konsantrasyonunda (% 0.02 ve % 0.01) biyofilm üretiminin, doğal suşa oranla istatistiki açıdan anlamlı bir şekilde düştüğü saptandı. Gerçek zamanlı PZR denemeleri sonucu, marT geninin S. Typhimurium'da; marT, slsA, misL, rmbA, fidL ve wzzB genlerinin pozitif; fliA, fliC, dps, fimA, cheA ve cheM genlerinin ise negatif regülatörü olduğu belirlendi. marT regülasyonu yönünden araştırılan genler bakımından mutant suşların in-vitro koşullarda biyofilm üretme kapasiteleri doğal suş ile kıyaslandığında, istatistiki açıdan anlamlı düşmeler gösteren mutantlar; fliA (% 59), fliC (% 40), fimA (% 46), fidL (% 25) ve misL (% 25) olarak belirlendi. Bu çalışmada kullanılan tüm suşların biyofilm yapıları agar plaklarda rdar morfotipte saptanmış olmasına rağmen, steromikroskop altında yapılan incelemelerde mutant suşların oluşturdukları rdar morfotipteki biyofilmlerin, hem birbirinden ve hem de doğal suştan farklı fenotipik özellikler gösterdiği belirlendi. Pelikül oluşumları değerlendirildiğinde; incelenen genlerden fimA, slsA, fliA, dps, cheA ve wzzB genlerinin S. Typhimurium'da pelikül oluşumu üzerinde doğrudan etkili olduğu saptandı. Son olarak; marT ifadesi indüklenen mutantın cam, çelik ve polistiren üzerinde biyofilm oluşturma özellikleri incelendi ve tüm yüzeylerde biyofilm üretme yeteneğinin düştüğü belirlendi.