Hepatit C virüs enfeksiyonlarında anti-viral direnç ile ilişkilendirilmiş varyantların Türk populasyonunda saptanması
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2017
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: ESRA YURDCU
Danışman: ABDURRAHMAN MİTHAT BOZDAYI
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Hepatit C virüs enfeksiyonu tüm dünyada ve ülkemizde önemli bir halk sağlığı sorunudur ve kronik HCV enfeksiyonu tedavi edilmezse karaciğer sirozu ve hepatoselüler karsinom riskini artmasına sebep olmaktadır. Kronik HCV enfeksiyonu tedavisinde son yıllarda önemli ilerlemeler gerçeklenmiş ve direkt etki eden antivirallerin kullanılması ile tedavi başarı oranı %90 ların üzerine çıkmıştır. Hepatit C virüsü bir RNA virüsüdür ve viral RNA genomlarında yaklaşık 3010 aminoasitlik büyük bir poliprotein sentezler. Bu poliproteinlerin translasyon sırasında ve sonrasında selüler ve viral proteazlar tarafından işlenmesiyle yapısal olan ve yapısal olmayan proteinler üretilir. Kronik HCV enfeksiyon tedavisinde kullanılmaya başlayan direkt etki eden antiviraller, virüsün yapısal olmayan proteinlerini (NS3, NS5A, NS5B) inhibe ederek virüsün replikasyonunu engellemeyi amaçlamaktadır. HCV viral polimerazın düzeltme aktivitesinin olmaması ve yüksek replikasyon hızına sahip olması, virüs genomunda birçok aminoasit değişiminin ortaya çıkmasına sebep olmaktadır. Bu aminoasit değişimlerinden bazıları, direkt etki eden antivirallerin hedeflediği, virüsün NS3, NS5A ve NS5B bölgesinde meydana gelenler, klinik açıdan önemli olan, antiviral dirence sebep olmaktadır. Bu tezin amacı, Türkiye'deki farklı HCV genotiplerine (1a, 1b, 2. 3, 4) sahip, daha önce DAA tedavisi almamış hastalarda HCV'nin NS3, NS5A ve NS5B bölgelerindeki dirençle ilgili alarak belirlenmiş aminoasit değişikliklerinin incelenmesidir. Çalışmada daha önce DAA tedavisi almamış, farklı genotiplerde (1b, 1a, 2, 3, 4) toplam 285 hastanın serum örneklerinden elde edilen HCV RNA'nın NS3, NS5A ve NS5B bölgelerinin dideoxy sanger sequencing yöntemi ile DNA dizi analizi yapıldı. Bu bölgelerde, dirençle ilgili olarak belirlenmiş aminoasit noktalarındaki nükleotit ve aminoasit değişiklikleri incelendi. Yapılan dizi analizi sonucunda HCV'nin NS3, NS5Ave NS5B bölgelerinde toplamda 285 hastada bakılan 48 adet dirençle ilgili aminoasit değişikliğinden 21 tanesi görülmüştür.