CRISPR/Cas9 yöntemi ile hıyar mozaik virüs (CMV)'üne dayanıklı transgenik olmayan kavun genotipinin geliştirilmesi


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2022

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: SERDAR ALTINTAŞ

Danışman: Ali Ergül

Özet:

CmVPS41 geni bazı viral faktörlerin iletim demetleri boyunca taşınımında rol oynadığı biinmektedir. CMV tarımsal üretimde ciddi zararlanmalara yol açmakta ve birçok bitki familyası bu virüsün doğal konukçusu durumundadır. CMV floem boyunca bitkinin üst aksamlarına doğru taşınmaktadır. Bu çalışmada CmVPS41 geninin fonksiyonu CRISPR/Cas9 yöntemiyle ortadan kaldırılmaya çalışılmıştır. Bu amaçla hedef bölgeye yönelik 2 tane sgRNA tasarlanmıştır. Golden Gate klonlama kullanılarak tek bir vektörde toplanan ekspresyon kasetleri Agrobacterium aracılığıyla aktarılmıştır. Doku kültüründe en uygun şartlar sürgün ortamı için 2.2 mg/L BAP ve 0.8 mg/L NAA olarak, köklendirme ortamı için ise 0.5 mg/L NAA olarak belirlenmiştir. Çalışma sonunda yetiştirilen bitkilerde yapılan analizler sonucu ağırlıklı olarak delesyon şeklinde mutasyonlar tespit edilmiştir.