Değişik kaynaklardan izole edilen mycobacterium bovis suşlarının moleküler tiplendirilmesi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2003
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: İSMAİL CEYHAN
Danışman: HAKAN YARDIMCI
Özet:56 ÖZET Değişik Kaynaklardan İzole Edilen Mycobacterium bovis Suşlarmm Moleküler Tiplendirilmesi Bu çalışmanın amacı değişik kaynaklardan izole edilen Mycobacterium bovis suşlarmm genotiplendirilmesinde PCR tabanlı iki moleküler yöntemin rutin kullanıma uygun olup olmadığının araştırılmasıdır. Mycobacterium bovis'in sebep olduğu "sığır tüberkülozu" uygulanmakta olan kontrol programlarına rağmen bir çok ülkede sığırlarda hastalık etkeni olarak önemini korumaktadır. Tüberkülozun moleküler tiplendirme teknikleri hastalığın kontrol ve korunmasında etkili yardımcı bir araç olarak umut verici görülmektedir. Çalışmada iki farklı PCR tabanlı tiplendirme yöntemi kullanılmıştır. Yöntemlerden biri IS6110 elementine yönelik spesifik ters yön tek primerin (OUT-primer) kullanıldığı OUT-PCR, diğeri ise Gram negatif bakterilerin genomunda bulunduğu saptanan bölgeye özel ERIC (enterobacterial repetitive intergenic concensus) primerlerinin seçildiği ERIC-PCR olarak uygulanmıştır. ERIC dizileri M. bovis genomunda da saptanmıştır. Her iki tiplendirme RAPD (random amplified polymorphic DNA) yöntemi olarak bilinmektedir. Bu çalışmada Ankara çevresi ve bazı diğer yerlerden toplanmış 21 M. bovis susu tiplendirilmiştir. Suşlardan 16'sı sığırlardan 5 'i ise insanlardan izole edilmiştir. ERIC-PCR yönteminin standardizasyonu zor ve yeterli ayrım yapamadığı saptanmıştır. OUT-PCR yönteminin ise kolay uygulanabildiği ve az sayıdaki laboratuvar susunun ayrımı amacıyla yararlı olduğu saptanmıştır. Ayrıca yöntemin fazla sayıdaki susun hızlı tarama amacıyla kullanılabileceği bulunmuştur. Ancak her iki tiplendirme yönteminin de geniş çaplı epidemiyolojik analiz çalışmalarında kullanılması uygun değildir. Anahtar Sözcükler: 1. ERIC-PCR 2. Mycobacterium bovis 3. Moleküler Tiplendirme 4. OUT-PCR 5. PCR