Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2013
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: ALİREZA FARAJİ MAJARASHİN
Danışman: SEVAL BİLGE DAĞALP
Özet:Bu çalışmada, İran’ın farklı bölgelerinde bulunan (9 farklı il) işletmelerde yetiştirilen6 ay yaşın üzerinde ve sağlıklı görünümlü ve PPR enfeksiyonuna karşı aşılanmadığıöğrenilen koyun ve keçilerden alınan kan serumu örnekleri ile ŞehrekordÜniversitesi tanı laboratuvarında bulunan, son iki yıla ait serum örnekleri olmaküzere toplam 502 kan serum örnekleri PPRV spesifik antikorlarını belirlemek üzereC-ELISA ile kontrol edilmiş ve seropozitiflik oranı % 53,38 (268/502) olarak tespitedilmiştir. Örnek alınan illerin birisi (Gilan) hariç hepsi PPRV yönünden seropozitifolarak tespit edilmiş ve seropozitiflik oranlarının illere göre %12.5-96.29 oranlarıarasında değişim gösterdiği belirlenmiştir. Hayvan türlerine göre seropozitiflikdeğerlerine bakıldığında ise, örneklenen koyunların %53.6 sı (238/444), keçilerin%51.7 si (30/58) PPRV spesifik antikorları yönünden pozitif olarak bulunmuştur.Araştırmada ayrıca, son yıllarda enfeksiyonun hızlı ve duyarlı tanısındakullanılan N proteinini kodlayan gen bölgesini hedef alan rtRT-PCR metodu, PPRVnükleik asit tespiti amacıyla kullanılmıştır. PPRV enfeksiyonu şüphesiyle alınantoplam 341 saha materyali (296 kan, 5 nazal swap ve 40 doku örneği) Taqman rtRTPCRtekniği ile test edilmiş ve söz konusu örneklerin %29.91 (102/341) i PPRVnükleik asiti yönünden pozitif olarak değerlendirilmiştir.İran’ın 4 farklı ilinden elde edilen 16 örnek dizin analiz çalışmasına dahiledilmiştir. Yapılan filogenetik analiz sonrasında, daha önceden moleküler çalışmalarile de ortaya konulduğu gibi, İran’da sirküle eden PPR viruslarının IV.genetik hattayer aldığı görülmüştür. Dört farklı ilden elde edilen 16 PPRV N kısmi gen dizinlerinükleotid düzeyinde kendi aralarında %96,8-100 benzerlik gösterirken; Türkiye 2000referans dizinleri ile %97,6-100 ve İran’da aşı suşu olarak kullanılan Nigeria 75/1dizinleri ile %88,2-89 oranında benzerlik göstermiştir. Bu çalışmada elde edilen Nkismi gen dizinleri, İran’da 1998 yılında bildirilen dizinler ile karşılaştırıldığındaaynı genetik hatta yer almalarına rağmen %95,2-96 oranında benzer bulunmuşlardır.PPRV enfeksiyonunun ülkede endemik olduğu bir kez daha ortaya konmuş; hayvanhareketlerinin sınırlandırılmasının zorluğuna dikkat çekerek, enfeksiyondankorunmada en etkili yolun duyarlı populasyonun aşılanması üzerinde durulmasıgerekliliği sonucuna varılmıştır.AbstractIn this study, a total of 502 blood sera samples from goats and sheep over the age of6 months, unvaccinated against PPR infection and healthy appearance in variousregion of Iran (9 province) and blood sera in diagnosis lab of Shahrekord Universitywere tested by C-ELISA against PPRV spesific antibodies. All of provinces werefound to be positive for PPRV antibodies except for Gilan. The seropositivity rateswere determined as 53.38% (268/502) for tested samples. The seropositivity rateswere ranged between 12.5% and 96.29% according to sampled provinces. Accordingto animal species, the value of seroprevalance for PPRV infection were found as53,6% (238/444) and 51,7% (30/58) in sheep and goats, respectively.Additionally, Taqman RT-real time PCR assay based on N protein coding generegion which is the rapid and sensitive for diagnosis of infection was used fordetection of PPRV nucleic acid. For this purpose, a total of 341 field specimens (296blood, 5 nasal swap, 40 tissue) from sheep and goats with suspicious PPRV infectionhas been tested by RT-rtPCR technique and resulting out of them, 29,91% (102/341)was detected as positive for PPRV nucleic acid.Sequence analysis were performed with the total of 16 samples from fourdifferent provinces of Iran. The phylogenetic tree based on the N partial genesequences, PPR viruses circulating in Iran were seen in lineage IV and closelyrelated to Turkey00 isolate as previously determined by the molecular studies in Iran.The data sequence analysis of 16 samples at nucleotid homology showed that 96,8-100% between them, 97,6-100% for reference isolate Turkey00 and 88,2-89% forstrain Nigeria 75/1 used as a vaccine strain in Iran. The assessment of N partialsequences obtained with the same lineage reported in Iran1998, at nucleotid levelshowed 95,2-96% homology. Thus, classification of PPRV into lineages based on theN gene sequences appeared to yield better picture of molecular epidemiology forPPRV. PPRV infection once again emphasis to be endemic in the Iran; attention tothe difficulty of limiting animal movement, it need to focus on the most effectiveway about vaccination of susceptible population for prevention of infection.