T Hücreli Non-Hodgkin lenfomalarda MikroRNA ifade profillendirmesi ve ayırıcı tanıdaki önemi


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2015

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: YASEMİN ŞAHİN

Danışman: IŞINSU KUZU

Özet:

T/NK hücreli non-Hodgkin lenfomalar (T/NKHNHL) patogenezleri ile ilgili sınırlı bilgi, ayırıcı tanıları ve tedavi başarılarında güçlükler bulunduran neoplazilerdir. MikroRNA'lar (miRNA) gen ifadelerini "post-transkripsiyonel" olarak regüle eden ve lenfoma dahil çoğu neoplazide anormal olarak ifade olan küçük RNA'lardır. Ayırıcı tanı ve hedefe yönelik tedaviler için önemli aday moleküllerdir. T/NKHNHL'lerda miRNA ifade profili ve patogenezdeki rolleri hakkında sınırlı bilgi bulunmaktadır. Bu çalışmada, birbiriyle ayırım güçlüğü bulunduran Anjioimmünoblastik T hücreli lenfomalar (AİTHL), CD30+ ve CD30- Periferik T hücreli lenfoma-NOS (PTHL-NOS) ve reaktif hiperplazi olgularının miRNA ifade profilli belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla, Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi (AÜTF) Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı'nda 2006-2013 yılları arasında CD30-/CD30+ PTHL-NOS, AİTHL ve benign reaktif hiperplazi tanısı almış olgular Dünya Sağlık Örgütü (WHO) kriterlerine göre iki patolog (GK ve IK) tarafından yeniden değerlendirilmiştir. Çalışmamızda, 6 CD30-, 6 CD30+ olmak üzere toplamda 12 PTHL-NOS ve 8 AİTHL ile 10 reaktif hiperplazi formalin tespitli parafine gömülü (FTPG) lenf nodu örneklerinde mikrodizin analizi gerçekleştirilmiştir. Nodal tip T/NK hücreli lenfomalar ile reaktif hiperplazi olguları arasında 62 miRNA'nın farklı şekilde ifade olduğu ve bunların çoğunluğunun T/NK hücreli lenfomalarda ifadesinin azaldığı belirlenmiştir (MannWhitneyU, p<0.001). hsa-miR-4746-3p'nin en fazla artış, hsa-miR-144-3p'nin ise en fazla azalış gösteren miRNA'lar olduğu bulunmuştur. Hasta alt gruplarından AİTHL ile CD30- PTHL-NOS arasında 1, AİTHL ile CD30+ PTHL-NOS arasında 7, CD30- PTHL-NOS ile CD30+ PTHL-NOS arasında 12 miRNA'nın farklı olarak ifade oldukları görülmüştür (Kruskal Wallis, p<0.05). AİTHL ile CD30+ PTHL-NOS arasında en fazla farklılık gösteren miRNA hsa-miR-99b-5p, AİTHL ile CD30- PTHL-NOS arasında hsa-miR-222-3p, CD30- ile CD30+ PTHL-NOS arasında hsa-miR-221-3p dır. Farklı şekilde ifade olduğu belirlenen 9 miRNA'nın 5'i QRT-PZR analizi ile doğrulanmıştır. Bu çalışma ile AİTHL, CD30+ ile CD30- PTHL-NOS hasta altgrupları ve reaktif hiperplazi örneklerinin birbirlerinden farklı miRNA ifadeleri sergiledikleri gösterilmiştir. Bunlar lenfoma antitelerinin gelişim biyolojisinin açıklanmasında kullanılabilecek aday belirteçler olabilirler.