Spondiloartropatili hastalarda,JAK 2, STAT3, TNFRSF1A gen polimorfizmlerinin incelenmesi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2013

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: SAEİD ASSADPOUR

Danışman: MUSTAFA TÜRKER DUMAN

Özet:

Spondiloartropatinin en anla?ılmı? türü olan Ankilozan spondilit (AS) hastalığı, etyopatogenezi tam olarak bilinmeyen, kronik, inflamatuvar bir hastalıktır. ?kiz çalı?malarında HLA-B27 geni ba?ta olmak üzere, genetiğin hastalık üzerinde önemli rolü olduğu gösterilmi?tir. Geni? genom taramaları (GWAS) son yıllarda hastalıkla ili?kili birçok gen belirlemi? ve MHC dı?ı genlerin de hastalık patogenezinde rolü olduğu öne sürülmü?tür. Biz bu çalı?mada, GWAS çalı?malarında AS ile ili?kilendirilen ve fonksiyonları dolayısı oynadıkları muhtemel patojenik rollerin AS yatkınlık yapabileceğini dü?ündüğümüz üç gende; STAT 3, JAK II ve TNFRSF1A vaka-kontrol genotiplendirme çalı?ması yaparak genlerin AS`le ili?kilerini ara?tırdık. Çalı?maya toplam 218 hasta ve 196 sağlıklı kontrol dahil edildi. JAK II genindeki rs10974944, STAT 3 geninde rs8074524 ve TNFRSF1A geninde R92Q (rs4149584) polimorfizmleri PCR-RFLP yöntemlerini kulanarak ara?tırdık. TNFRSF1A genindeki rs4149584 R/Q ve JAK II genindeki rs10974944 (C/G) polimorfizmler incelendiğinde, hasta ve sağlıklı kontroller arasında istatistiksel olarak anlamlı bir farklılık bulunmamı?tır (Bu değer TNFRSF1A için OR=0.90 p=0.82 CI=0.33-2.43 ve JAK II için OR=0.72, p=0.30 CI=0.35-1.51.). STAT 3 genindeki rs8074524 (C/T) polimorfizminin, hastalar ve sağlıklı kontroller kar?ıla?tırıldığında HLA-B27`den bağımsız olarak AS`e yatkınlık yaptığı bulunmu?tur (OR=4.24, p=0.001 %95 CI=1.70-10.60). Elde ettiğimiz veriler incelenen rs8074524 deği?ikliğinin hastalarda yakla?ık 4 kat yüksek olduğunu göstermekte ve STAT3 geninin AS yatkınlık yapan risk faktörlerinden biri olabileceğini göstermektedir. Hastalığı yatkınlık yapan genlerin belirlenmesi olası ilaç tedavileri içinde bu genlerin hedeflenmesine yol açarak kliniğe yansıyabilecek etkiler içermesi açısından önemlidir. AbstractAnkylosing spondylitis is a chronic inflammatory disease of which type of Spondyloarthropathies, and its etiopathogenesis has yet remain unclear. AS is type of Spondyloarthropathies. Twin studies confirm that susceptibility to AS is, especially for the HLA-B27 gene, entirely genetically. In recent years, Genome-wide association study (GWAS) identified several genes associated with the disease and role of non-MHC genes in AS pathogenesis has been suggested. In this study we planned to investigate three genes, STAT 3, JAK II and TNFRSF1A which were found associated with AS susceptibility by GWAS studies and also the functions of these proteins might probably play a pathogenic role in AS . We designed a case-control genotyping study. A total of 218 patients and 196 healthy controls were included in the study. Rs10974944 in JAK II, rs8074524 in STAT3 and R92Q (rs4149584) in TNFRSF1A were investigated by PCR-RFLP methods. The polymorphisms inTNRSF1A and JAK II genes did not statistically differ between patients and healthy controls. (For TNFRSF1A ;OR=0.90 P=0.82 CI=0.33-2.43 and for JAK II; OR=0.72, P=0.30 CI=0.35-1.51). T/T genotype in STAT3 gene was significantly higher in patients ( about 4-fold), compared to healthy controls (OR: 4.24, p=0.001 %95 CI:1.70-10.60). Our data shows that, STAT3 gene may be one of the risk factors that predispose to AS independently from HLA-B27. The identification of genes that predispose to disease, may help to find potential drug treatments, by targeting these genes and clinical applications may be possible.