Tavuk orijinli salmonella suşlarında antibiyotik dirençliliğinin konvansiyonel ve moleküler analizi

MERVE ÖZDAL SALAR

Tavuk orijinli salmonella suşlarında antibiyotik dirençliliğinin konvansiyonel ve moleküler analizi

Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, VETERİNERLİK MİKROBİYOLOJİSİ ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2022

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: MERVE ÖZDAL SALAR

Danışman: Hakan Yardımcı

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu araştırmada, tavuk orijinli Salmonella suşlarında antibiyotik dirençliliğinin konvansiyonel ve moleküler olarak analiz edilmesi amaçlandı. Çalışmada, tavuk orijinli 30 S. Infantis suşu, 30 S. Enteritidis ve 35 S. Typhimurium olmak üzere toplam 95 adet suş kullanıldı. Kirby-Bauer disk diffuzyon tekniğine esas alınarak gentamisin, kanamisin, streptomisin, eritromisin, tetrasiklin, siprofloksasin, nalidiksit asit, ampisilin, sefotaksim ve seftazidim, kloramfenikol, sulfonamid ve trimetoprim/sülfametaksazol antibiyotikleri çalışıldı. Antibiyotik dirençliliğin moleküler olarak analizi için tetrasiklin direncinde rol oynayan tet(A), kinolon direncinde rol oynayan gyrA ve aminoglikozid grubundan kanamisin direncinde rol oynayan aphA genlerine spesifik primerlerin kullanıldığı konvasiyonel PCR yöntemi uygulandı. S. Infantis suşlarının 28 (%93)'i streptomisin'e, 29 (%96) 'u sülfanomid'e, 29 (%96) 'u eritromisin'e, 30 (%100)'u sefotaksim'e, 30 (%100)'u ampisilin'e, 30 (%100)'u ceftazidim'e, 27 (%90) 'si trimetoprim/sülfametaksazol'e, (%96) 'u tetrasiklin'e, 23 (%76)'ü gentamisin'e, 20 (%66) 'si kloramfenikol'e, 30 (%100)'u nalidiksik asit'e, 29 (%96) 'u kanamisin'e, 30 (%100)'u siprofloksasin'e dirençli bulunmuştur. S. Enteritidis suşlarının 29 (%96) 'u streptomisin'e, 29 (96)'u sülfanomid'e, 30 (%100)'u eritromisin'e, 30 (%100)'u sefotaksim'e, 29 (%96)'u ampisilin'e, 30 (%100)'u ceftazidim'e, 28 (%93)'i trimetoprim/sülfametaksazol'e, 30 (%100)'u tetrasiklin'e, 25 (%83)'i gentamisin'e, 23 (%83)'ü kloramfenikol'e, 30 (%100)'u nalidiksik asit'e, 28 (%93) 'i kanamisin'e, 30 (%100)'u siprofloksasin'e dirençli bulunmuştur. S. Typhimurium suşlarının 30 (%100)'u streptomisin'e, 30 (%100)'u sülfanomid'e, 30 (%100)'u eritromisin'e, (%100)'u sefotaksim'e, 30 (%100)'u ampisilin'e, 30 (%100)'u ceftazidim'e, 30 (%100)'u trimetoprim/sülfametaksazol'e, 30 (%100) 'u tetrasiklin'e, 30 (%100)'u gentamisin'e, 21 (%60)'i kloramfenikol'e, 30 (%100)'u nalidiksik asit'e, 30 (%100)'u kanamisin'e, 30 (%100)'u siprofloksasin'e dirençli bulunmuştur. Aminoglikozid grubundan kanamisin direncinde rol oynayan aphA geni hiçbir S. Infantis suşunda tespit edilmezken, S. Enteritidis suşundan 5 tanesinde, 35 adet S. Typhimurium suşundan 3 tanesinde saptandı. Tetrasiklin direncinde rol oynayan tetA geni 30 adet S. Infantis suşundan 17 tanesinde, 30 adet S. Enteritidis suşundan 12 tanesinde, 35 adet S. Typhimurium suşundan 1 tanesinde saptandı. Kinolon direncinde rol oynayan gyrA 30 adet S. Infantis suşundan 7 tanesinde, 30 adet S. Enteritidis suşundan 14, 35 adet S. Typhimurium suşundan 22 (%63)'sinde saptandı. Sonuç olarak çalışmaya dahil edilen Türkiye'nin farklı bölgelerinde faaliyet gösteren işletmelerden elde edilen Salmonella suşlarının seçilen antibiyotiklere karşı önemli oranda dirence sahip olduğu ve benzer şekilde çoklu antibiyotik direncine taşıdığı belirlenmiştir.