Klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarından elde edilen bakteriyofajlarda bulunan SCIN, CHIPS, SEI, SEK toksin genlerinin varlığının PZR ve southern blot yöntemi ile kıyaslanması

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2012

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: ZEYNEP BURÇİN ÇAVUŞOĞLU

Danışman: FİKRET ŞAHİN

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bakteriyofajlar, taşıdıkları toksin genleri sayesinde bakterilere farklı fenotipik özellikler kazandırırlar. Bu özelliklerin tespit edilmesi ve araştırılması, mikrobiyal biyoteknoloji çalışmaları açısından önemlidir. Bu amaçla çeşitli moleküler yöntemler geliştirilmiştir. Staphylococcus aureus, hastane ve toplum kaynaklı enfeksiyonlara sebep olan en önemli patojenlerden biridir. Bu çalışmada, S. aureus suşlarından elde edilen fajlarda bulunan SCIN, CHIPS, SEI, SEK toksin genlerinin varlığı PZR ile tespit edilmiştir. Southern Blot hibridizasyon yöntemi ile bu toksin genlerinin varlığı doğrulanmıştır. Bu iki yöntem duyarlılık ve özgüllük açısından karşılaştırılmıştır. Son yıllarda bulunan bu toksin genleri ile ilgili az sayıda çalışma bulunmaktadır. Analizler sonucunda; PZR yönteminde daha az konsantrasyonda DNA'ya ihtiyaç duyulurken, Southern Blot hibridizasyon yönteminde daha fazla konsantrasyonda DNA'ya ihtiyaç olduğu görülmüştür. PZR ve Southern Blot Hibridizasyon yöntemlerinin özgüllük açısından benzer olduğu tespit edilmiştir.