İnsan sitomegalovirus (HCMV) suçlarında fosfotransferaz (UL97) ve DNA polimeraz (UL54) kodlayan gen bölgelerindeki mutasyonların bovine herpesvirus-1 ile karşılaştırılmalı analizi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, VİROLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2004
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: DİLEK ÇOLAK
Danışman: AYKUT ÖZKUL
Özet:64 6. ÖZET Bu araştırmada HCMV viruslarında in vivo, BHV-1 vuruşlarında ise in vitro şartlarda yapılan antiherpetik preparatlara duyarlılık bulguları ışığında HCMV için UL54 (DNA polimeraz) ve UL97 (fosfotransferaz), BHV-1 virusları için ise sadece UL30 (DNA polimeraz) genleri düzeyinde analizler yapıldı. Çalışmaya HCMV infeksiyonu olan 42 olguya ait 62 örnek ve 5 adet BHV-1 virusu dahil edildi. HCMV infeksiyonu olan olgulara ait örnekler UL54 ve UL97 gen bölgelerine ait mutasyon analizlerinin yapılması amacıyla PZR reaksiyonuna tabi tutuldu. Bu örneklerin 41 adedinde UL54 gen bölgesi, 36 adedinde UL97 gen bölgesi amplifiye edilebildi. Her iki gene ait PZR ürünleri UL54 için Taal; UL97 için HaeIII ve Fsel enzimleriyle kesilmek suretiyle RFLP yöntemi ile incelendi. UL54 ve UL97 genlerine ilgili RFLP analizinde 2 'şer farklı kesim kalıbı bulunurken, bunların hiç biri mutasyonlar için daha önce belirtilen kesim kalıplarına uyumlu bulunmadı. Yapılan DNA dizin analizi sonucunda; farklı RFLP kesim kalıpları elde edilen örneklerde değişen sayılarda mutasyonlar elde edildi. Bu mutasyonlardan sadece birer tanesinin UL54 analizi yapılan 51 nolu örnekte ve UL97 analizi yapılan 56 nolu örnekde bilinen aminoasit dizinlerinde değişikliklere neden olduğu tespit edildi. UL54 gen dizisi temelinde yapılan filogenetik değerlendirme neticesinde 40 ve 51 nolu örnek nükleotid dizinlerinin birbirlerinden oldukça farklı oldukları tespit edildi. Araştırmada kullanılan BHV-1 izolatlarının tamamı in vitro foskarnet muamelesi sonucunda enfektivitelerini %100 oranında yitirirken, gansiklovir muamelesi sonrasında sadece 1 adet örnekte (BHV1/ANK4) 2 log düzeyinde bir enfektivite kaybı tespit edildi. Bu viruslarını DNA polimeraz kodlayan gen (UL30) bölgelerine ait analiz neticesinde aminoasit düzeyine ve söz konusu genin fonksiyonel II bölgesine intikal eden önemli mutasyonlar tespit edildi. Anahtar Kelimeler: HCMV, antiviral rezistans, UL54, UL97, BHV-1, UL30