Türkiye’den izole edilen Salmonella suşlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin tanımlanması


Creative Commons License

Doç. Dr. BAŞAR KARACA

Tez Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji (Yl) (Tezli), Türkiye

Tez Danışmanı: Cumhur Çökmüş

Tezin Onay Tarihi: 2011

Tezin Dili: Türkçe

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu çalışmada; serotiplendirmesi yapılmış 99 ve cins düzeyinde tanımlanmış 41 adet Türkiye kökenli Salmonella suşunun biyofilm oluşturma karakteristikleri araştırıldı. 140 adet suşun biyofilm oluşturma özellikleri incelendiğinde % 56.4’nün “rdar”, %40.7’sinin “bdar” ve %2.1’nin ise “pdar” morfotipinde biyofilm ürettiği belirlendi. 1 adet S. Agona suşu daha önce belirtilen hiçbir morfotipe dahil edilemedi. 79 adet “rdar” morfotipi içeren suşun 72’sinde; 57 adet “bdar” morfotipi içeren suşun ise 41’inde sıvı-hava arafazında pelikül yapısına rastlandı. Suşlar, oluşturdukları pelikül yapılarına, pelikülün fiziksel farklılıklarına ve pelikül oluşumuyla birlikte besi ortamlarında meydana gelen değişimlere göre değerlendirildi. “Rdar” morfotipi içeren suşların rijit yapıda; “bdar” morfotipi içeren suşların ise kırılgan yapıda pelikül oluşturduğu saptandı. Biyofilm matriks yapılarındaki selüloz varlığının araştırılmasında, 79 adet “rdar” ve 3 adet “pdar” morfotipi içeren suşun kalkofloru bağlayıp UV ışık altında florosan özellik gösterdiği; 57 adet “bdar” ve 1 adet tanımlanamayan morfotip içeren suşun ise kalkofloru bağlamadığı dolayısıyla UV ışık altında florosan özellik göstermediği belirlendi. Kongo kırmızısı içeren ortamda yoğun “rdar” morfotipi içerdiği saptanan 38 adet suşun ve her morfotipi temsilen seçilen birer suşun polistiren ve paslanmaz çelik gibi abiyotik yüzeyler üzerinde biyofilm oluşturma kabiliyetleri araştırıldı. Polistiren plaklarda seçilen suşların biyofilm üretme miktarlarının ölçülmesi sonucunda en yoğun biyofilm üretimi Salmonella Typhimurium suşunda belirlendi (OD: 3,418). İdeal biyofilm üretimi koşularının belirlenmesi amacıyla farklı sıcaklık, su aktivitesi ve pH değerlerinde gerçekleştirilen çalışmalar sonucunda, biyofilm oluşumu için en uygun sıcaklığın 20 °C, NaCl konsantrasyonunun % 0.0 olduğu belirlenirken; pH’nın farklı morfotip içeren suşların biyofilm oluşturma özellikleri üzerindeki etkisinin değişkenlik gösterdiği saptandı. Matriks yapısında bulunması muhtemel hücre dışı DNA’nın varlığı “bdar” morfotipi içeren S. Infantis suşunda tespit edildi.