Omiks Teknolojileri

Büyük İ.

  • Dersin Düzeyi: Yüksek Lisans
  • Tasarlanan Ders Kodu: 800400715181
  • Öğretim Türü: Örgün Öğretim (Normal Öğretim)
  • Dersin Kapsamı: Teorik
  • Akademik Yıl: 2022 - 2023
  • Ders İçeriği:

    Bu dersin amacı, organizmanın/organizmaların yapısını, fonksiyonlarını ve dinamiklerini dönüşen biyolojik molekül havuzlarıyla toplu karakterizasyonunun ve miktarının belirlenmesini ve bu yolların hangi tekniklerle yapılabileceğini derinlemesine analiz etmektir.


    Ayrıntılı haftalık ders konularının belirtildiği program 

    Haftalar

    Teorik

    Uygulama

     

     

     

    1.  

    Omiks teknolojilerine giriş

    Omiks teknojisi ve alt dallarının tanıtılması 

    1.  

    Tüm genom dizileme 

    Shotgun ve Klon-kontiq yöntemlerinin tanıtılması

    1.  

    Vektörler ve özellikleri

    Plazmit, viral, kozmit, BAC ve YAC vektörlerinin derinlemesine analizi

    1.  

    1. nesil dizileme teknikleri

    Sanger ve maxam gilbert yöntemlerinin tanıtılması

    1.  

    Yeni Nesil Dizileme teknolojilerine temel bakış ve kullanım alanları

    2. ve 3. nesil dizileme teknolojilerinin tanıtılması

    1.  

    Transkriptomiks

    Gen ifade profillerinin çıkarılması

    1.  

    Transkriptomiks alanına ait teknolojler

    Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu, Revers-Transkriptaz Polimeraz Zincir Reaksiyonu, Differential Display Yöntemi (DİDİ), Suppression Subtractive Hybridization (SSH), Serial Analysis Gene Expression (SAGE)

    1.  

    Transkriptomiks alanına ait teknolojler

    Mikroarray yöntemi, RNA-seq Yöntemi

    1.  

    Proteomiks

    protein yapıları, post-translayonal modifikasyonlar

    1.  

    Proteomiks

    2D jel elektroforezi; izoeletkrik odaklama (IEF) ve moleküler ağırlık

    1.  

    Proteomiks

    Proteom analiz basamakları

    1.  

    Proteomiks

    Kütle spektrometresi (MS); size exclusion kromotografisi, iyon değişim kromotografisi, affinity kromotografisi, gaz kromotografisi, sıvı kromotografisi, yüksek basınçlı sıvı kromotografisi, NMR

    1.  

    Kütle spektrometresi (MS)

    Kütle spektrometresi (MS) bölümleri; inlet, iyonlaştırma kaynağı, kütle analizi, dedektör, data sistemi

    1.  

    Metabolomiks                    

    Metabolom parmakizi, metabolom hedefleme, metabolom profilleme