Akademik Veri Yönetim Sistemi
Dersin amacı, öğrencilere biyoinformatikte uygulanılan tekniklerin hem öğretilmesi ve bu tekniklerin teorik arka planının anlatılılmasıdır. Biyolojik diziler üzerinde durulacaktır (DNA, RNA ve protein).
Bu ders biyolojideki genom dizileme gibi son gelişmelerden üretilen büyük miktardaki bilgiyi veri madenciliği aracılığıyla işlemek için öğrenilmesi gereken hesaplama tekniklerini kapsamaktadır.
| Hafta | Konular | Kullanılan Öğretim Yöntemi, Teknikleri ve Yaklaşım | Öğrenme Faaliyetleri |
| 1. Hafta | Giriş, DNA replikasyonu, transkripsiyonu, translasyonu ve genom organizasyonunun gözden geçirilmesi | Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 2. Hafta | Omiks, biyoinformatik ve bilgisayarlı biyolojiye giriş | Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 3. Hafta | Biyolojik veri tabanları, veri depolama, dosya formatları ve veri eldesine giriş | Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 4. Hafta | DNA ve protein veritabanlarında arama - İleri düzey veritabanı arama | Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 5. Hafta | Dizilerin hizalanması, bölgesel hizalama, tam hizalama, çoklu hizalama | Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 6. Hafta | Moleküler filogeni ve evrim | Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 7. Hafta | Ara Sınav | Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 8. Hafta | Moleküler filogeni ve evrim-devamı | Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 9. Hafta | Genom informatiği ve yüksek verimli dizileme teknolojileri | Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 10. Hafta | Genom informatiği ve yüksek verimli dizileme teknolojileri-devamı | Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 11. Hafta | Sistem biyolojisi | Anlatım Bilimsel Tartışma Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 12. Hafta | Biyolojik bilgiyi yayma - Etik, güvenlik ve uygulama | Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 13. Hafta | Biyoinformatiğin geleceği | Anlatım Bilimsel Tartışma Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |
| 14. Hafta | Biyoinformatiğin geleceği | Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme | Sunum (Hazırlı Süresi Dahil) |