INTRODUCTION TO BIOINFORMATICS

Dersin Düzeyi: Lisans
Tasarlanan Ders Kodu: BIO212
Öğretim Türü: Örgün Öğretim (Normal Öğretim)
Dersin Kapsamı: Teorik
Akademik Yıl: 2020 - 2021

Ders İçeriği:

Dersin amacı, öğrencilere biyoinformatikte uygulanılan tekniklerin hem öğretilmesi ve bu tekniklerin teorik arka planının anlatılılmasıdır. Biyolojik diziler üzerinde durulacaktır (DNA, RNA ve protein).

Bu ders biyolojideki genom dizileme gibi son gelişmelerden üretilen büyük miktardaki bilgiyi veri madenciliği aracılığıyla işlemek için öğrenilmesi gereken hesaplama tekniklerini kapsamaktadır.

HAFTALIK KONULAR (İÇERIK)

Hafta	Konular	Kullanılan Öğretim Yöntemi, Teknikleri ve Yaklaşım	Öğrenme Faaliyetleri
1. Hafta	Giriş, DNA replikasyonu, transkripsiyonu, translasyonu ve genom organizasyonunun gözden geçirilmesi	Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
2. Hafta	Omiks, biyoinformatik ve bilgisayarlı biyolojiye giriş	Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
3. Hafta	Biyolojik veri tabanları, veri depolama, dosya formatları ve veri eldesine giriş	Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
4. Hafta	DNA ve protein veritabanlarında arama - İleri düzey veritabanı arama	Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
5. Hafta	Dizilerin hizalanması, bölgesel hizalama, tam hizalama, çoklu hizalama	Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
6. Hafta	Moleküler filogeni ve evrim	Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
7. Hafta	Ara Sınav	Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
8. Hafta	Moleküler filogeni ve evrim-devamı	Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
9. Hafta	Genom informatiği ve yüksek verimli dizileme teknolojileri	Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
10. Hafta	Genom informatiği ve yüksek verimli dizileme teknolojileri-devamı	Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
11. Hafta	Sistem biyolojisi	Anlatım Bilimsel Tartışma Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
12. Hafta	Biyolojik bilgiyi yayma - Etik, güvenlik ve uygulama	Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
13. Hafta	Biyoinformatiğin geleceği	Anlatım Bilimsel Tartışma Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)
14. Hafta	Biyoinformatiğin geleceği	Anlatım Beyin Fırtınası Beyin Temelli Öğrenme	Sunum (Hazırlı Süresi Dahil)