Bazı Yeni 1H-İndol Karboksamit Türevlerinin Sentezi, Yapılarının Aydınlatılması,Biyolojik Aktiviteleri ve Moleküler Modelleme Çalışmaları


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Ankara Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi, Eczacılık Meslek Bilimleri Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2025

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: AÇELYA MAVİDENİZ

Danışman: Ali Hakan Göker

Özet:

Bu tez çalışması kapsamında kanser tedavisinde kullanılabilecek yeni aktif aday bileşiklerin keşfedilmesi ve ileri çalışmalar için farmasötik kimya alanına katkıda bulunmak hedeflenmiştir.

Bu amaçla 21’i sonuç ürün olmak üzere toplamda 33 bileşik sentezlenmiştir. Sonuç ürünleri elde etmek üzere iki farklı sentez yöntemi uygulanmıştır. Birinci yöntemde 2-(N-substitüe-1H-indol-3-il) asetamid türevi yeni bileşiklerin sentezlenmesi alkilasyon ve amidleştirme olarak iki basamakta gerçekleşmiştir. Böylece ara bileşikler A1-A11 ve sonuç ürünler olarak A13-A31 bileşikleri elde edilmiştir.

İkinci yöntem ise 3 basamaklı bir tepkime olup 5-Kloro-(N1-substitüe)-1H-indol-2-N-sübstitüe-karboksamid türevi bileşiklerin sentezi için uygulanmıştır. Birinci aşamada esterleştirme tepkimesi yapılmıştır. İkinci adımda alkilasyon işlemi gerçekleşmiş ve bileşik A12 elde edilmiştir. Üçüncü aşamada amidleştirme reaksiyonu yapılmış ve sonuç ürünler olan karboksamid türevleri A32 ve A33 elde edilmiştir.

Bileşiklerin saflık kontrolleri İTK ve erime noktası tayini yöntemleri kullanılarak gerçekleştirilmiş, gerekli durumlarda kolon kromatografisi kullanılarak bileşiklerin saflığı arttırılmıştır. Sentezlenen bileşiklerin kimyasal yapıları, 1H-NMR Spektroskopisi, 13C-NMR Spektroskopisi, 2D NMR yöntemleri (COSY ve NOESY), HSQC, HMBC ve Kütle Spektrometrisi gibi enstrümental analiz yöntemleri kullanılarak aydınlatılmıştır.

Sentezlenen ve yapıları aydınlatılan bu yeni bileşikler, 3-(4,5-dimetiltiyazol-2-il)-2,5-difeniltetrazolyum bromür (MTT) testi ile THP1 (insan monositik lösemi hücre serisi), Jurkat (T lenfosit hücre serisi), MCF7 (insan meme adenokarsinomu hücre serisi) ve L929 (fare fibroblast hücre serisi) hücre hatlarına karşı in vitro sitotoksik aktiviteler için test edilmiştir. Pozitif kontrol olarak 5-Fluorouracil (5-FU) kemoterapotik ajanı kullanılmıştır. Moleküler modelleme sonuçları ile bileşiklerin aktivite kıyaslamaları değerlendirilmiştir. Sitotoksik etkileri saptanan bileşikler A23, A24, A25 ve A26 ile tedavi edilen hücrelerde, hücre canlılığı önemli ölçüde azalmıştır. MTT tahlilinin sonuçlarına bakıldığında, sentezlenen indol asetamid türevleri ile 72 saat süreyle tedavi, tüm kanser hücrelerinin canlılığını doza bağlı bir şekilde azaltabilmiştir. Özellikle Bileşik A25 ve Bileşik A26’nın THP1 dışındaki tüm hücre hatlarında pozitif kontrol 5-FU’e kıyasla daha etkin olduğu gözlemlenmiştir.

Aktif bileşikler arasında en yüksek doking skoru, bileşik A26 tarafından elde edilmiştir ve bu bileşik, güçlü bağlanma potansiyeline işaret etmektedir. Bileşik A25 ise bileşik A26’yı yakından takip etmektedir. Her iki bileşik de, özellikle His95 ile hidrojen bağı ve Phe183 ile π-π istiflenme etkileşimleri ile, ko-kristalize ligand E3R’ye benzer etkileşimler oluşturmuştur.